Thermotoga petrophila RKU-1 [gbbct]: 1787 CDS's (576165 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 19.0( 10971)  UCU 12.3(  7073)  UAU  9.9(  5730)  UGU  4.1(  2371)
UUC 32.7( 18825)  UCC 12.0(  6889)  UAC 25.9( 14946)  UGC  2.9(  1658)
UUA  3.4(  1964)  UCA  7.2(  4158)  UAA  0.6(   353)  UGA  2.2(  1279)
UUG 12.8(  7356)  UCG  7.7(  4460)  UAG  0.3(   155)  UGG 11.0(  6315)

CUU 24.0( 13810)  CCU  9.9(  5689)  CAU  5.3(  3043)  CGU  2.9(  1644)
CUC 32.9( 18965)  CCC 10.3(  5924)  CAC 10.6(  6120)  CGC  2.0(  1169)
CUA  2.5(  1443)  CCA  9.7(  5568)  CAA  4.9(  2824)  CGA  3.1(  1780)
CUG 24.5( 14089)  CCG  9.8(  5652)  CAG 15.1(  8677)  CGG  1.7(   982)

AUU 13.8(  7934)  ACU  7.5(  4335)  AAU 11.2(  6443)  AGU  7.9(  4563)
AUC 30.0( 17272)  ACC 12.4(  7171)  AAC 25.1( 14487)  AGC  8.7(  4991)
AUA 28.1( 16200)  ACA 12.9(  7413)  AAA 42.7( 24610)  AGA 29.1( 16793)
AUG 22.7( 13079)  ACG 12.5(  7204)  AAG 33.5( 19287)  AGG 15.9(  9146)

GUU 27.1( 15620)  GCU 13.8(  7979)  GAU 28.6( 16454)  GGU 19.5( 11214)
GUC 15.9(  9144)  GCC 14.3(  8225)  GAC 21.4( 12336)  GGC  8.1(  4646)
GUA  9.9(  5677)  GCA 14.5(  8354)  GAA 56.7( 32642)  GGA 32.5( 18748)
GUG 33.7( 19392)  GCG 15.1(  8715)  GAG 33.0( 19010)  GGG  9.0(  5199)

Coding GC 46.26% 1st letter GC 52.20% 2nd letter GC 34.24% 3rd letter GC 52.33%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
Homepage