Pyrobaculum islandicum DSM 4184 [gbbct]: 1984 CDS's (533466 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 21.2( 11311)  UCU 13.6(  7271)  UAU 21.1( 11273)  UGU  5.5(  2939)
UUC 14.2(  7590)  UCC  5.6(  2981)  UAC 21.4( 11407)  UGC  3.3(  1742)
UUA 16.9(  9033)  UCA  5.9(  3142)  UAA  1.5(   780)  UGA  1.0(   532)
UUG 14.2(  7587)  UCG  6.9(  3669)  UAG  1.3(   672)  UGG 13.5(  7210)

CUU 20.4( 10892)  CCU 11.4(  6108)  CAU  6.2(  3323)  CGU  6.0(  3180)
CUC 21.8( 11620)  CCC 14.0(  7484)  CAC  9.2(  4883)  CGC  6.7(  3551)
CUA 18.8( 10042)  CCA 12.2(  6485)  CAA 10.3(  5503)  CGA  2.1(  1096)
CUG 13.4(  7157)  CCG 12.3(  6551)  CAG 10.7(  5713)  CGG  5.3(  2820)

AUU 16.7(  8906)  ACU 11.1(  5902)  AAU  9.6(  5129)  AGU  5.6(  3002)
AUC 14.2(  7566)  ACC  9.0(  4787)  AAC 15.3(  8164)  AGC  9.7(  5200)
AUA 35.2( 18775)  ACA 15.7(  8368)  AAA 28.1( 14970)  AGA 27.2( 14514)
AUG 18.2(  9719)  ACG 11.4(  6064)  AAG 28.8( 15362)  AGG 21.0( 11225)

GUU 20.3( 10845)  GCU 19.8( 10548)  GAU 17.9(  9570)  GGU  9.6(  5122)
GUC 19.9( 10603)  GCC 30.3( 16158)  GAC 26.4( 14084)  GGC 33.8( 18048)
GUA 26.2( 13992)  GCA 17.8(  9519)  GAA 23.3( 12438)  GGA 12.9(  6869)
GUG 29.8( 15874)  GCG 23.2( 12352)  GAG 46.3( 24711)  GGG 17.9(  9533)

Coding GC 49.53% 1st letter GC 55.61% 2nd letter GC 40.11% 3rd letter GC 52.88%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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