Escherichia coli [gbbct]: 8087 CDS's (2330943 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 24.4( 56791)  UCU 13.1( 30494)  UAU 21.6( 50400)  UGU  5.9( 13662)
UUC 13.9( 32513)  UCC  9.7( 22637)  UAC 11.7( 27239)  UGC  5.5( 12777)
UUA 17.4( 40627)  UCA 13.1( 30502)  UAA  2.0(  4664)  UGA  1.1(  2674)
UUG 12.9( 30084)  UCG  8.2( 19071)  UAG  0.3(   751)  UGG 13.4( 31207)

CUU 14.5( 33816)  CCU  9.5( 22121)  CAU 12.4( 28919)  CGU 15.9( 37134)
CUC  9.5( 22074)  CCC  6.2( 14379)  CAC  7.3( 17117)  CGC 14.0( 32720)
CUA  5.6( 12951)  CCA  9.1( 21237)  CAA 14.4( 33607)  CGA  4.8( 11216)
CUG 37.4( 87261)  CCG 14.5( 33795)  CAG 26.7( 62329)  CGG  7.9( 18434)

AUU 29.6( 68942)  ACU 13.1( 30518)  AAU 29.3( 68348)  AGU 13.2( 30749)
AUC 19.4( 45213)  ACC 18.9( 44139)  AAC 20.3( 47233)  AGC 14.3( 33255)
AUA 13.3( 31065)  ACA 15.1( 35293)  AAA 37.2( 86726)  AGA  7.1( 16583)
AUG 23.7( 55356)  ACG 13.6( 31794)  AAG 15.3( 35652)  AGG  4.0(  9238)

GUU 21.6( 50261)  GCU 18.9( 44034)  GAU 33.7( 78663)  GGU 23.7( 55283)
GUC 13.1( 30515)  GCC 21.6( 50411)  GAC 17.9( 41619)  GGC 20.6( 47962)
GUA 13.1( 30461)  GCA 23.0( 53619)  GAA 35.1( 81727)  GGA 13.6( 31729)
GUG 19.9( 46309)  GCG 21.1( 49169)  GAG 19.4( 45154)  GGG 12.3( 28720)

Coding GC 47.30% 1st letter GC 53.83% 2nd letter GC 40.61% 3rd letter GC 47.45%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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