Roseobacter denitrificans OCh 114 [gbbct]: 4130 CDS's (1292904 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 19.2( 24887)  UCU  4.3(  5576)  UAU 13.0( 16746)  UGU  3.1(  3977)
UUC 19.8( 25609)  UCC 12.8( 16505)  UAC  9.4( 12173)  UGC  6.5(  8365)
UUA  1.3(  1702)  UCA  5.5(  7166)  UAA  0.8(  1031)  UGA  1.9(  2434)
UUG 17.2( 22183)  UCG 13.3( 17134)  UAG  0.5(   665)  UGG 13.6( 17633)

CUU 14.9( 19317)  CCU  5.8(  7508)  CAU 11.2( 14481)  CGU  9.6( 12388)
CUC 14.7( 19016)  CCC 16.2( 20902)  CAC  9.5( 12241)  CGC 31.6( 40839)
CUA  1.6(  2026)  CCA  5.1(  6653)  CAA 10.8( 13930)  CGA  3.1(  3965)
CUG 48.5( 62764)  CCG 21.8( 28232)  CAG 23.8( 30762)  CGG 13.7( 17675)

AUU 13.7( 17743)  ACU  3.1(  3951)  AAU 10.0( 12888)  AGU  4.1(  5263)
AUC 37.1( 47931)  ACC 23.6( 30454)  AAC 18.0( 23296)  AGC 13.8( 17831)
AUA  2.9(  3804)  ACA  9.4( 12166)  AAA 15.5( 20070)  AGA  2.0(  2558)
AUG 27.8( 35902)  ACG 20.6( 26641)  AAG 17.4( 22506)  AGG  2.9(  3777)

GUU 13.0( 16808)  GCU  9.5( 12337)  GAU 31.7( 41030)  GGU 16.9( 21857)
GUC 24.6( 31748)  GCC 42.2( 54597)  GAC 29.8( 38552)  GGC 39.3( 50804)
GUA  3.7(  4745)  GCA 19.4( 25142)  GAA 31.4( 40618)  GGA  6.8(  8768)
GUG 31.8( 41054)  GCG 48.5( 62666)  GAG 24.5( 31715)  GGG 21.0( 27197)

Coding GC 59.42% 1st letter GC 63.60% 2nd letter GC 45.09% 3rd letter GC 69.56%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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