Thermofilum pendens Hrk 5 [gbbct]: 1876 CDS's (545977 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number]) 
UUU  6.0(  3288)  UCU  5.7(  3094)  UAU  3.4(  1839)  UGU  1.4(   743)
UUC 31.2( 17043)  UCC 15.5(  8463)  UAC 35.1( 19140)  UGC  6.2(  3386)
UUA  4.9(  2672)  UCA  3.1(  1687)  UAA  0.9(   502)  UGA  1.0(   523)
UUG  9.7(  5296)  UCG 14.6(  7949)  UAG  1.6(   851)  UGG 12.4(  6758)

CUU 13.3(  7260)  CCU  7.0(  3826)  CAU  1.9(  1062)  CGU  2.6(  1408)
CUC 42.7( 23328)  CCC 17.9(  9757)  CAC 12.3(  6698)  CGC 10.1(  5490)
CUA 17.0(  9285)  CCA  5.0(  2715)  CAA  4.1(  2231)  CGA  2.0(  1110)
CUG 28.5( 15551)  CCG 17.5(  9545)  CAG 14.1(  7677)  CGG  5.6(  3071)

AUU  5.5(  3025)  ACU  5.8(  3162)  AAU  2.6(  1439)  AGU  3.2(  1754)
AUC 14.9(  8154)  ACC 11.7(  6393)  AAC 19.8( 10816)  AGC 21.1( 11493)
AUA 24.8( 13552)  ACA  5.8(  3188)  AAA 11.4(  6216)  AGA 11.1(  6063)
AUG 16.6(  9049)  ACG 17.7(  9662)  AAG 38.8( 21160)  AGG 40.8( 22255)

GUU 17.3(  9440)  GCU 17.7(  9670)  GAU  8.0(  4389)  GGU 10.3(  5647)
GUC 30.2( 16464)  GCC 29.4( 16074)  GAC 33.0( 18018)  GGC 29.0( 15858)
GUA 22.1( 12042)  GCA 11.4(  6197)  GAA 16.5(  8986)  GGA 12.9(  7069)
GUG 33.7( 18415)  GCG 34.1( 18622)  GAG 61.8( 33731)  GGG 27.0( 14726)
Coding GC 58.22% 1st letter GC 59.59% 2nd letter GC 41.64% 3rd letter GC 73.43%
Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM
CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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