Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300 [gbbct]: 2604 CDS's (798491 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 32.8( 26188)  UCU 12.9( 10320)  UAU 30.7( 24514)  UGU  5.0(  3956)
UUC 11.8(  9431)  UCC  1.6(  1310)  UAC  8.4(  6704)  UGC  1.2(   938)
UUA 54.1( 43233)  UCA 20.5( 16339)  UAA  2.4(  1920)  UGA  0.3(   279)
UUG 13.3( 10655)  UCG  3.8(  3052)  UAG  0.5(   405)  UGG  7.5(  5977)

CUU 10.7(  8536)  CCU 10.8(  8587)  CAU 18.4( 14682)  CGU 13.3( 10602)
CUC  2.0(  1594)  CCC  0.9(   752)  CAC  4.5(  3561)  CGC  3.1(  2482)
CUA  8.5(  6755)  CCA 16.2( 12951)  CAA 36.4( 29051)  CGA  4.8(  3851)
CUG  2.3(  1813)  CCG  3.9(  3147)  CAG  5.0(  4009)  CGG  0.4(   348)

AUU 52.3( 41794)  ACU 16.7( 13362)  AAU 43.6( 34784)  AGU 16.8( 13444)
AUC 14.6( 11678)  ACC  2.6(  2057)  AAC 13.4( 10725)  AGC  5.2(  4114)
AUA 18.6( 14881)  ACA 28.8( 22991)  AAA 61.7( 49292)  AGA 11.7(  9308)
AUG 25.8( 20563)  ACG  9.4(  7511)  AAG 14.1( 11277)  AGG  1.4(  1115)

GUU 27.3( 21815)  GCU 20.3( 16192)  GAU 46.2( 36853)  GGU 32.7( 26082)
GUC  7.3(  5829)  GCC  4.4(  3538)  GAC 12.5( 10017)  GGC  9.3(  7451)
GUA 22.7( 18119)  GCA 29.9( 23902)  GAA 54.9( 43830)  GGA 14.2( 11350)
GUG  9.4(  7492)  GCG  9.3(  7423)  GAG 10.4(  8327)  GGG  4.3(  3433)

Coding GC 33.45% 1st letter GC 45.63% 2nd letter GC 32.33% 3rd letter GC 22.38%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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