Escherichia coli UTI89 [gbbct]: 5211 CDS's (1570760 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 22.9( 35934)  UCU  8.7( 13719)  UAU 16.3( 25596)  UGU  5.5(  8566)
UUC 16.5( 25960)  UCC  8.9( 14001)  UAC 12.1( 19043)  UGC  6.8( 10623)
UUA 13.8( 21631)  UCA  7.9( 12381)  UAA  2.0(  3154)  UGA  1.1(  1657)
UUG 13.8( 21718)  UCG  8.8( 13794)  UAG  0.3(   401)  UGG 15.2( 23820)

CUU 11.7( 18333)  CCU  7.4( 11633)  CAU 13.2( 20804)  CGU 20.4( 32104)
CUC 10.9( 17146)  CCC  5.7(  9017)  CAC  9.7( 15233)  CGC 21.2( 33292)
CUA  4.0(  6250)  CCA  8.6( 13458)  CAA 15.1( 23705)  CGA  3.8(  6035)
CUG 51.0( 80075)  CCG 22.1( 34690)  CAG 29.5( 46355)  CGG  6.2(  9671)

AUU 29.9( 47001)  ACU  9.1( 14346)  AAU 18.3( 28811)  AGU  9.4( 14765)
AUC 24.4( 38257)  ACC 22.7( 35672)  AAC 21.4( 33619)  AGC 15.8( 24845)
AUA  5.2(  8149)  ACA  8.0( 12581)  AAA 33.2( 52077)  AGA  2.8(  4377)
AUG 27.2( 42790)  ACG 14.9( 23404)  AAG 10.6( 16679)  AGG  1.9(  2960)

GUU 18.6( 29216)  GCU 15.7( 24668)  GAU 32.1( 50456)  GGU 24.4( 38382)
GUC 15.1( 23704)  GCC 25.3( 39688)  GAC 18.8( 29527)  GGC 28.0( 44055)
GUA 11.1( 17463)  GCA 20.6( 32435)  GAA 38.4( 60386)  GGA  8.9( 13954)
GUG 25.7( 40445)  GCG 32.2( 50640)  GAG 17.8( 27998)  GGG 11.2( 17611)

Coding GC 51.53% 1st letter GC 58.47% 2nd letter GC 40.93% 3rd letter GC 55.18%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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