Haloquadratum walsbyi DSM 16790 [gbbct]: 2646 CDS's (790110 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 16.9( 13362)  UCU  9.6(  7618)  UAU 18.3( 14422)  UGU  5.4(  4270)
UUC 15.1( 11910)  UCC  5.6(  4404)  UAC  9.2(  7233)  UGC  2.2(  1738)
UUA  8.9(  7054)  UCA 22.0( 17397)  UAA  1.2(   987)  UGA  1.6(  1233)
UUG  7.7(  6090)  UCG 10.3(  8117)  UAG  0.5(   426)  UGG 10.1(  7986)

CUU 28.5( 22544)  CCU  8.1(  6379)  CAU 13.1( 10335)  CGU 14.7( 11621)
CUC 21.7( 17123)  CCC  4.6(  3651)  CAC  7.9(  6271)  CGC 10.0(  7895)
CUA  5.4(  4286)  CCA 20.1( 15847)  CAA 16.9( 13333)  CGA 17.4( 13768)
CUG  9.3(  7365)  CCG 10.8(  8503)  CAG 17.3( 13649)  CGG 10.4(  8221)

AUU 31.8( 25129)  ACU 17.0( 13395)  AAU 22.4( 17671)  AGU 12.3(  9686)
AUC 21.9( 17276)  ACC 14.5( 11495)  AAC 12.0(  9442)  AGC  8.3(  6565)
AUA  8.0(  6305)  ACA 30.4( 24058)  AAA 13.6( 10761)  AGA  3.8(  3013)
AUG 17.8( 14027)  ACG 16.6( 13128)  AAG  9.8(  7722)  AGG  1.5(  1222)

GUU 29.7( 23463)  GCU 24.5( 19391)  GAU 51.7( 40840)  GGU 24.6( 19456)
GUC 24.4( 19312)  GCC 12.9( 10173)  GAC 26.1( 20641)  GGC 12.5(  9837)
GUA  9.6(  7562)  GCA 36.6( 28930)  GAA 36.3( 28714)  GGA 23.2( 18346)
GUG 14.3( 11328)  GCG 19.2( 15151)  GAG 37.7( 29809)  GGG 14.2( 11224)

Coding GC 48.84% 1st letter GC 61.38% 2nd letter GC 43.50% 3rd letter GC 41.63%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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