Lactobacillus salivarius subsp. salivarius UCC118 [gbbct]: 2033 CDS's (591631 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 31.7( 18750)  UCU 17.0( 10071)  UAU 30.8( 18237)  UGU  4.5(  2638)
UUC 11.3(  6682)  UCC  3.0(  1768)  UAC  9.0(  5325)  UGC  1.2(   739)
UUA 50.8( 30033)  UCA 15.4(  9124)  UAA  2.3(  1356)  UGA  0.4(   219)
UUG 18.3( 10804)  UCG  2.3(  1335)  UAG  0.8(   458)  UGG  9.6(  5670)

CUU 11.3(  6657)  CCU 12.5(  7421)  CAU 14.4(  8514)  CGU 13.2(  7823)
CUC  1.9(  1100)  CCC  0.9(   561)  CAC  3.6(  2117)  CGC  2.6(  1550)
CUA 11.8(  6996)  CCA 16.2(  9581)  CAA 31.2( 18446)  CGA  3.8(  2241)
CUG  2.5(  1488)  CCG  1.7(   997)  CAG  5.0(  2939)  CGG  0.8(   457)

AUU 48.6( 28758)  ACU 23.3( 13784)  AAU 44.2( 26167)  AGU 18.4( 10884)
AUC 12.8(  7574)  ACC  3.6(  2156)  AAC 11.8(  6984)  AGC  4.6(  2698)
AUA 17.4( 10321)  ACA 24.4( 14453)  AAA 54.4( 32213)  AGA 15.6(  9256)
AUG 25.5( 15079)  ACG  3.7(  2196)  AAG 26.3( 15536)  AGG  2.3(  1339)

GUU 32.6( 19284)  GCU 32.5( 19253)  GAU 48.4( 28623)  GGU 28.5( 16847)
GUC  4.5(  2644)  GCC  4.8(  2854)  GAC 10.0(  5899)  GGC  6.3(  3740)
GUA 25.5( 15114)  GCA 24.9( 14708)  GAA 56.8( 33579)  GGA 22.8( 13491)
GUG  6.0(  3566)  GCG  4.0(  2371)  GAG  9.0(  5296)  GGG  4.8(  2867)

Coding GC 33.29% 1st letter GC 45.47% 2nd letter GC 32.98% 3rd letter GC 21.43%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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