Mycobacterium ulcerans Agy99 [gbbct]: 8401 CDS's (2770231 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  5.3( 14807)  UCU  2.0(  5658)  UAU  5.6( 15600)  UGU  2.1(  5729)
UUC 24.2( 67032)  UCC 12.4( 34438)  UAC 15.1( 41908)  UGC  7.0( 19296)
UUA  1.2(  3403)  UCA  3.4(  9410)  UAA  0.5(  1434)  UGA  1.6(  4296)
UUG 17.9( 49724)  UCG 18.7( 51744)  UAG  1.0(  2671)  UGG 14.8( 40868)

CUU  4.6( 12709)  CCU  2.8(  7800)  CAU  6.2( 17222)  CGU  8.6( 23924)
CUC 18.9( 52397)  CCC 19.1( 52967)  CAC 16.9( 46729)  CGC 30.2( 83625)
CUA  4.0( 11195)  CCA  5.5( 15290)  CAA  8.6( 23848)  CGA  6.6( 18299)
CUG 51.4(142254)  CCG 29.2( 80873)  CAG 23.3( 64583)  CGG 22.6( 62607)

AUU  6.0( 16691)  ACU  3.6(  9888)  AAU  5.3( 14759)  AGU  4.0( 11140)
AUC 36.0( 99837)  ACC 38.6(107003)  AAC 19.0( 52538)  AGC 15.2( 42242)
AUA  2.0(  5670)  ACA  3.9( 10685)  AAA  5.3( 14727)  AGA  1.1(  3059)
AUG 19.3( 53441)  ACG 14.2( 39217)  AAG 16.4( 45456)  AGG  3.0(  8365)

GUU  7.9( 21822)  GCU 10.0( 27724)  GAU 16.9( 46793)  GGU 17.0( 46968)
GUC 33.0( 91526)  GCC 62.1(172056)  GAC 41.8(115663)  GGC 45.7(126736)
GUA  4.2( 11755)  GCA 12.4( 34397)  GAA 17.7( 49091)  GGA 11.1( 30868)
GUG 38.9(107866)  GCG 47.2(130810)  GAG 31.6( 87525)  GGG 17.9( 49573)

Coding GC 65.68% 1st letter GC 67.41% 2nd letter GC 49.37% 3rd letter GC 80.27%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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