Pseudomonas putida F1 [gbbct]: 5252 CDS's (1763090 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number]) 
UUU  6.9( 12166)  UCU  2.2(  3880)  UAU  6.8( 11998)  UGU  1.8(  3260)
UUC 28.5( 50257)  UCC  8.2( 14378)  UAC 18.6( 32795)  UGC  8.4( 14763)
UUA  1.2(  2034)  UCA  2.6(  4600)  UAA  0.6(  1111)  UGA  2.0(  3550)
UUG 16.8( 29699)  UCG 13.9( 24494)  UAG  0.3(   591)  UGG 14.4( 25383)

CUU  6.5( 11496)  CCU  5.7( 10098)  CAU  7.7( 13557)  CGU 12.9( 22770)
CUC 14.4( 25380)  CCC 11.3( 19858)  CAC 15.7( 27736)  CGC 37.0( 65291)
CUA  2.2(  3820)  CCA  6.9( 12175)  CAA 10.7( 18846)  CGA  2.7(  4812)
CUG 76.5(134933)  CCG 25.1( 44259)  CAG 36.3( 63989)  CGG 10.0( 17712)

AUU  9.3( 16335)  ACU  4.1(  7293)  AAU  6.0( 10647)  AGU  5.1(  8988)
AUC 34.4( 60625)  ACC 32.0( 56506)  AAC 23.5( 41401)  AGC 24.0( 42231)
AUA  1.7(  2964)  ACA  3.1(  5502)  AAA  9.0( 15822)  AGA  0.8(  1439)
AUG 23.1( 40660)  ACG  8.4( 14837)  AAG 24.0( 42251)  AGG  2.0(  3460)

GUU  6.5( 11526)  GCU 11.2( 19758)  GAU 15.6( 27434)  GGU 16.3( 28667)
GUC 21.1( 37172)  GCC 59.0(104109)  GAC 37.5( 66203)  GGC 50.2( 88548)
GUA  7.3( 12838)  GCA 13.3( 23383)  GAA 27.1( 47768)  GGA  2.3(  4069)
GUG 37.8( 66611)  GCG 28.5( 50224)  GAG 29.0( 51087)  GGG 11.9( 21041)
Coding GC 62.52% 1st letter GC 65.63% 2nd letter GC 43.75% 3rd letter GC 78.19%
Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM
CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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