Mycobacterium vanbaalenii PYR-1 [gbbct]: 6027 CDS's (1995145 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  1.8(  3562)  UCU  1.4(  2878)  UAU  3.6(  7121)  UGU  1.5(  3089)
UUC 28.6( 57127)  UCC 13.0( 25974)  UAC 17.4( 34717)  UGC  6.7( 13424)
UUA  0.4(   841)  UCA  2.6(  5163)  UAA  0.2(   483)  UGA  2.1(  4126)
UUG  9.6( 19116)  UCG 20.3( 40504)  UAG  0.7(  1418)  UGG 15.0( 29977)

CUU  3.8(  7535)  CCU  2.8(  5579)  CAU  4.3(  8497)  CGU  7.0( 14060)
CUC 25.9( 51596)  CCC 19.2( 38268)  CAC 17.7( 35313)  CGC 31.8( 63439)
CUA  1.2(  2455)  CCA  2.8(  5672)  CAA  3.7(  7451)  CGA  4.8(  9508)
CUG 56.1(111903)  CCG 33.4( 66724)  CAG 25.3( 50435)  CGG 24.3( 48522)

AUU  2.4(  4870)  ACU  2.3(  4497)  AAU  2.8(  5553)  AGU  2.7(  5348)
AUC 38.0( 75891)  ACC 36.9( 73707)  AAC 18.7( 37394)  AGC 13.5( 26975)
AUA  0.8(  1611)  ACA  3.4(  6881)  AAA  3.4(  6780)  AGA  1.2(  2445)
AUG 19.4( 38655)  ACG 18.4( 36806)  AAG 17.4( 34757)  AGG  3.9(  7780)

GUU  3.8(  7625)  GCU  5.7( 11367)  GAU 11.5( 23018)  GGU 14.8( 29543)
GUC 41.3( 82367)  GCC 61.2(122107)  GAC 52.7(105119)  GGC 47.4( 94565)
GUA  2.2(  4313)  GCA 10.5( 20929)  GAA 14.4( 28765)  GGA  9.2( 18260)
GUG 41.8( 83379)  GCG 52.7(105212)  GAG 38.7( 77222)  GGG 17.5( 34927)

Coding GC 68.15% 1st letter GC 68.95% 2nd letter GC 49.03% 3rd letter GC 86.48%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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