Simian immunodeficiency virus [gbvrl]: 1465 CDS's (382895 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 16.8(  6433)  UCU 12.2(  4663)  UAU 22.2(  8490)  UGU 18.1(  6947)
UUC  9.0(  3458)  UCC 10.9(  4185)  UAC 13.8(  5290)  UGC 12.8(  4888)
UUA 18.1(  6919)  UCA 17.2(  6572)  UAA  1.6(   630)  UGA  1.4(   517)
UUG 18.2(  6981)  UCG  3.3(  1270)  UAG  0.8(   310)  UGG 28.1( 10775)

CUU  9.5(  3648)  CCU 12.6(  4833)  CAU 13.9(  5338)  CGU  1.1(   436)
CUC 12.3(  4693)  CCC  9.5(  3624)  CAC  6.2(  2362)  CGC  4.8(  1841)
CUA 15.9(  6088)  CCA 26.7( 10238)  CAA 25.6(  9792)  CGA  4.6(  1758)
CUG 14.5(  5539)  CCG  4.9(  1893)  CAG 29.0( 11109)  CGG  2.3(   872)

AUU 14.3(  5465)  ACU 19.6(  7490)  AAU 28.0( 10726)  AGU  8.6(  3284)
AUC 12.9(  4957)  ACC 11.0(  4221)  AAC 19.1(  7321)  AGC  9.2(  3519)
AUA 22.3(  8541)  ACA 27.4( 10502)  AAA 32.3( 12363)  AGA 36.6( 14018)
AUG 20.9(  8010)  ACG  3.6(  1369)  AAG 29.4( 11262)  AGG 19.1(  7318)

GUU  7.8(  2981)  GCU 15.4(  5911)  GAU 23.8(  9100)  GGU  8.3(  3197)
GUC  9.1(  3493)  GCC 10.1(  3886)  GAC 13.8(  5275)  GGC 13.0(  4971)
GUA 18.4(  7048)  GCA 27.9( 10694)  GAA 40.1( 15335)  GGA 31.1( 11904)
GUG 13.0(  4968)  GCG  7.1(  2717)  GAG 33.2( 12713)  GGG 15.5(  5944)

Coding GC 44.53% 1st letter GC 48.11% 2nd letter GC 43.42% 3rd letter GC 42.06%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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