Acidiphilium cryptum JF-5 [gbbct]: 3559 CDS's (1184349 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  4.6(  5505)  UCU  1.4(  1629)  UAU  9.6( 11416)  UGU  1.0(  1221)
UUC 30.2( 35761)  UCC 11.0( 12977)  UAC 10.0( 11895)  UGC  7.6(  9015)
UUA  0.6(   666)  UCA  1.9(  2309)  UAA  0.3(   336)  UGA  2.4(  2796)
UUG  5.1(  6040)  UCG 17.2( 20383)  UAG  0.4(   427)  UGG 12.9( 15322)

CUU  7.2(  8561)  CCU  2.6(  3024)  CAU 10.8( 12734)  CGU  5.1(  6042)
CUC 38.5( 45623)  CCC 16.3( 19263)  CAC 11.9( 14074)  CGC 44.2( 52357)
CUA  1.2(  1377)  CCA  2.9(  3444)  CAA  3.5(  4173)  CGA  2.9(  3482)
CUG 51.5( 60970)  CCG 35.2( 41713)  CAG 23.7( 28055)  CGG 25.2( 29793)

AUU  5.7(  6788)  ACU  1.5(  1814)  AAU  6.9(  8135)  AGU  1.9(  2290)
AUC 44.0( 52103)  ACC 28.2( 33395)  AAC 15.9( 18783)  AGC 13.8( 16297)
AUA  1.3(  1533)  ACA  2.9(  3433)  AAA  4.7(  5563)  AGA  1.1(  1259)
AUG 22.8( 27031)  ACG 18.6( 22069)  AAG 18.6( 22056)  AGG  3.2(  3760)

GUU  5.4(  6423)  GCU  5.4(  6393)  GAU 19.7( 23320)  GGU  6.4(  7604)
GUC 31.8( 37694)  GCC 68.9( 81589)  GAC 32.7( 38673)  GGC 60.2( 71279)
GUA  1.6(  1947)  GCA  8.3(  9876)  GAA 16.9( 19997)  GGA  5.9(  6931)
GUG 31.5( 37334)  GCG 64.0( 75792)  GAG 33.7( 39944)  GGG 17.6( 20861)

Coding GC 67.89% 1st letter GC 69.27% 2nd letter GC 49.77% 3rd letter GC 84.63%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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