Halorhodospira halophila SL1 [gbbct]: 2407 CDS's (818401 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  4.0(  3247)  UCU  1.2(   992)  UAU  4.3(  3520)  UGU  1.7(  1425)
UUC 26.5( 21689)  UCC 11.3(  9288)  UAC 19.4( 15881)  UGC  7.3(  5962)
UUA  0.7(   581)  UCA  1.3(  1071)  UAA  0.5(   421)  UGA  1.7(  1409)
UUG  6.4(  5266)  UCG 11.8(  9697)  UAG  0.7(   577)  UGG 14.3( 11698)

CUU  4.3(  3523)  CCU  2.4(  1955)  CAU  4.2(  3401)  CGU  9.0(  7340)
CUC 29.8( 24354)  CCC 18.4( 15053)  CAC 20.3( 16587)  CGC 44.0( 36043)
CUA  2.4(  1965)  CCA  2.6(  2152)  CAA  4.2(  3425)  CGA  4.3(  3556)
CUG 63.4( 51888)  CCG 30.2( 24744)  CAG 34.3( 28069)  CGG 27.5( 22502)

AUU  3.3(  2739)  ACU  2.0(  1602)  AAU  3.8(  3149)  AGU  3.5(  2895)
AUC 36.9( 30159)  ACC 32.8( 26809)  AAC 16.2( 13255)  AGC 15.8( 12957)
AUA  0.6(   502)  ACA  1.7(  1416)  AAA  2.3(  1875)  AGA  0.6(   504)
AUG 19.2( 15675)  ACG 11.5(  9424)  AAG 15.3( 12494)  AGG  1.4(  1124)

GUU  4.3(  3516)  GCU  6.7(  5512)  GAU 21.1( 17236)  GGU 12.4( 10142)
GUC 33.1( 27056)  GCC 70.3( 57520)  GAC 39.4( 32256)  GGC 46.7( 38246)
GUA  2.8(  2291)  GCA  6.6(  5381)  GAA 12.9( 10555)  GGA  4.7(  3887)
GUG 35.3( 28867)  GCG 35.7( 29245)  GAG 61.8( 50555)  GGG 24.8( 20276)

Coding GC 68.27% 1st letter GC 71.98% 2nd letter GC 46.66% 3rd letter GC 86.17%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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