Methanospirillum hungatei JF-1 [gbbct]: 3139 CDS's (1017233 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 25.6( 26065)  UCU 12.9( 13090)  UAU 23.7( 24129)  UGU  8.9(  9057)
UUC 14.2( 14423)  UCC 12.2( 12371)  UAC 10.6( 10813)  UGC  4.8(  4898)
UUA  9.6(  9764)  UCA 20.7( 21076)  UAA  1.4(  1443)  UGA  1.4(  1383)
UUG  5.8(  5933)  UCG  5.7(  5754)  UAG  0.3(   313)  UGG 10.5( 10709)

CUU 28.0( 28438)  CCU 11.7( 11860)  CAU 16.1( 16373)  CGU  7.8(  7955)
CUC 21.0( 21403)  CCC  9.1(  9232)  CAC  5.9(  6028)  CGC  3.2(  3267)
CUA  3.5(  3550)  CCA 11.0( 11203)  CAA  7.4(  7531)  CGA  5.8(  5886)
CUG 23.6( 23991)  CCG 14.8( 15084)  CAG 24.4( 24837)  CGG 16.0( 16283)

AUU 32.4( 32912)  ACU 11.3( 11543)  AAU 23.2( 23574)  AGU  9.7(  9917)
AUC 35.0( 35564)  ACC 24.3( 24711)  AAC 12.8( 13057)  AGC  5.7(  5807)
AUA 17.8( 18128)  ACA 13.7( 13950)  AAA 30.8( 31294)  AGA 10.4( 10590)
AUG 26.0( 26412)  ACG  8.3(  8411)  AAG 19.5( 19840)  AGG  8.5(  8663)

GUU 20.5( 20835)  GCU 13.5( 13773)  GAU 41.5( 42238)  GGU 18.3( 18653)
GUC 19.3( 19649)  GCC 16.8( 17096)  GAC 15.9( 16213)  GGC 10.0( 10159)
GUA 13.4( 13646)  GCA 31.4( 31914)  GAA 38.3( 38942)  GGA 27.7( 28153)
GUG 12.2( 12415)  GCG  7.8(  7951)  GAG 29.2( 29735)  GGG 17.1( 17346)

Coding GC 46.13% 1st letter GC 54.23% 2nd letter GC 39.10% 3rd letter GC 45.06%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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