Nitrobacter hamburgensis X14 [gbbct]: 4326 CDS's (1327882 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  9.1( 12104)  UCU  2.7(  3563)  UAU 10.6( 14056)  UGU  1.7(  2276)
UUC 27.2( 36134)  UCC 11.8( 15692)  UAC 11.5( 15215)  UGC  7.0(  9278)
UUA  1.3(  1786)  UCA  3.6(  4825)  UAA  0.6(   768)  UGA  1.9(  2523)
UUG 11.9( 15743)  UCG 21.0( 27884)  UAG  0.8(  1035)  UGG 13.2( 17550)

CUU 10.7( 14203)  CCU  4.4(  5872)  CAU 10.0( 13213)  CGU  8.6( 11466)
CUC 27.6( 36694)  CCC 12.4( 16505)  CAC 11.3( 15042)  CGC 36.3( 48235)
CUA  2.3(  3111)  CCA  4.4(  5865)  CAA  7.8( 10292)  CGA  5.9(  7771)
CUG 42.0( 55721)  CCG 30.8( 40919)  CAG 23.9( 31709)  CGG 18.1( 23985)

AUU  9.7( 12873)  ACU  3.4(  4525)  AAU  9.7( 12821)  AGU  3.3(  4321)
AUC 40.9( 54262)  ACC 26.0( 34562)  AAC 18.5( 24503)  AGC 15.2( 20189)
AUA  2.5(  3271)  ACA  4.7(  6296)  AAA 10.0( 13297)  AGA  2.1(  2781)
AUG 22.7( 30157)  ACG 20.5( 27278)  AAG 27.6( 36612)  AGG  4.5(  6008)

GUU  9.6( 12743)  GCU 10.0( 13314)  GAU 23.6( 31276)  GGU 10.7( 14243)
GUC 33.9( 45070)  GCC 46.6( 61888)  GAC 34.4( 45673)  GGC 49.8( 66107)
GUA  3.3(  4435)  GCA 12.5( 16633)  GAA 22.0( 29154)  GGA 10.2( 13524)
GUG 26.8( 35534)  GCG 52.0( 69108)  GAG 30.4( 40417)  GGG 10.5( 13972)

Coding GC 62.54% 1st letter GC 64.29% 2nd letter GC 46.61% 3rd letter GC 76.71%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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