Lactobacillus casei ATCC 334 [gbbct]: 2845 CDS's (816412 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 25.2( 20569)  UCU  6.4(  5252)  UAU 21.0( 17134)  UGU  2.1(  1688)
UUC 16.5( 13455)  UCC  6.0(  4934)  UAC 11.7(  9592)  UGC  2.0(  1593)
UUA 18.7( 15245)  UCA 11.0(  9013)  UAA  1.8(  1461)  UGA  1.0(   837)
UUG 29.9( 24378)  UCG  7.1(  5809)  UAG  0.7(   547)  UGG 11.1(  9065)

CUU 14.9( 12177)  CCU  8.1(  6622)  CAU 14.6( 11892)  CGU 11.1(  9088)
CUC 10.0(  8161)  CCC  3.9(  3198)  CAC  8.4(  6867)  CGC 13.3( 10818)
CUA  7.9(  6420)  CCA 15.0( 12259)  CAA 28.3( 23125)  CGA  7.4(  6019)
CUG 19.3( 15757)  CCG 13.8( 11275)  CAG 19.4( 15867)  CGG  9.9(  8064)

AUU 37.1( 30310)  ACU 13.2( 10787)  AAU 23.7( 19350)  AGU 13.3( 10877)
AUC 24.3( 19802)  ACC 20.3( 16567)  AAC 16.9( 13828)  AGC 11.2(  9143)
AUA  2.6(  2120)  ACA 15.1( 12348)  AAA 31.5( 25716)  AGA  2.2(  1789)
AUG 26.6( 21685)  ACG 17.0( 13899)  AAG 25.0( 20399)  AGG  1.1(   921)

GUU 26.5( 21627)  GCU 25.5( 20826)  GAU 39.3( 32051)  GGU 22.5( 18389)
GUC 20.1( 16401)  GCC 26.2( 21377)  GAC 19.5( 15918)  GGC 28.3( 23066)
GUA  6.0(  4899)  GCA 23.2( 18927)  GAA 33.3( 27176)  GGA  7.5(  6086)
GUG 18.9( 15428)  GCG 20.8( 16997)  GAG 13.6( 11112)  GGG 10.3(  8410)

Coding GC 47.22% 1st letter GC 54.67% 2nd letter GC 38.70% 3rd letter GC 48.30%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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