Synechococcus sp. JA-3-3Ab [gbbct]: 2760 CDS's (829078 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 19.9( 16539)  UCU  7.1(  5873)  UAU  7.8(  6454)  UGU  3.6(  2951)
UUC 14.4( 11906)  UCC 15.0( 12453)  UAC 18.2( 15069)  UGC  7.1(  5893)
UUA  2.5(  2090)  UCA  2.2(  1815)  UAA  0.7(   604)  UGA  1.2(   961)
UUG 28.7( 23798)  UCG  7.8(  6487)  UAG  1.4(  1195)  UGG 18.0( 14933)

CUU  7.7(  6348)  CCU 10.8(  8947)  CAU  5.5(  4550)  CGU  5.5(  4541)
CUC 21.9( 18139)  CCC 27.9( 23152)  CAC 13.7( 11317)  CGC 33.0( 27328)
CUA  6.5(  5405)  CCA  6.2(  5159)  CAA 19.3( 16040)  CGA  5.2(  4350)
CUG 58.5( 48502)  CCG 17.9( 14859)  CAG 37.1( 30741)  CGG 22.5( 18684)

AUU 14.4( 11980)  ACU  5.9(  4880)  AAU  5.7(  4765)  AGU  3.5(  2864)
AUC 30.8( 25564)  ACC 25.6( 21185)  AAC 18.5( 15348)  AGC 19.8( 16386)
AUA  1.4(  1201)  ACA  3.7(  3060)  AAA 10.6(  8829)  AGA  2.8(  2282)
AUG 15.8( 13119)  ACG  9.8(  8099)  AAG 18.2( 15074)  AGG  4.2(  3447)

GUU 10.2(  8493)  GCU 17.3( 14355)  GAU 23.2( 19219)  GGU  5.9(  4912)
GUC 14.7( 12228)  GCC 54.4( 45081)  GAC 19.4( 16059)  GGC 35.3( 29233)
GUA  5.3(  4410)  GCA 10.0(  8287)  GAA 21.4( 17718)  GGA 11.1(  9208)
GUG 39.6( 32796)  GCG 19.8( 16439)  GAG 42.1( 34891)  GGG 24.8( 20583)

Coding GC 61.14% 1st letter GC 65.37% 2nd letter GC 44.47% 3rd letter GC 73.57%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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