Shewanella putrefaciens CN-32 [gbbct]: 3972 CDS's (1327458 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 29.1( 38598)  UCU 10.2( 13561)  UAU 20.1( 26676)  UGU  6.1(  8127)
UUC 10.7( 14267)  UCC  6.1(  8045)  UAC 10.0( 13226)  UGC  4.4(  5862)
UUA 35.6( 47306)  UCA 11.7( 15544)  UAA  1.9(  2539)  UGA  0.5(   630)
UUG 17.4( 23125)  UCG  7.1(  9383)  UAG  0.6(   803)  UGG 12.3( 16292)

CUU 15.7( 20904)  CCU 13.1( 17360)  CAU 14.7( 19486)  CGU 17.5( 23191)
CUC 12.8( 16955)  CCC  8.6( 11386)  CAC  8.0( 10671)  CGC 13.4( 17744)
CUA 10.9( 14500)  CCA 12.3( 16355)  CAA 32.1( 42616)  CGA  4.8(  6332)
CUG 16.5( 21921)  CCG  6.2(  8259)  CAG 15.7( 20854)  CGG  3.4(  4490)

AUU 32.9( 43685)  ACU 15.1( 20033)  AAU 25.5( 33899)  AGU 15.3( 20300)
AUC 21.3( 28325)  ACC 18.1( 23981)  AAC 15.4( 20498)  AGC 13.8( 18299)
AUA  8.8( 11731)  ACA 11.7( 15499)  AAA 34.6( 45873)  AGA  4.4(  5834)
AUG 25.8( 34268)  ACG  9.7( 12898)  AAG 15.7( 20783)  AGG  2.4(  3183)

GUU 18.7( 24782)  GCU 21.9( 29093)  GAU 40.1( 53286)  GGU 28.1( 37366)
GUC 13.2( 17522)  GCC 26.9( 35754)  GAC 13.2( 17492)  GGC 22.8( 30284)
GUA 12.8( 17043)  GCA 23.2( 30744)  GAA 37.7( 50094)  GGA  8.3( 10958)
GUG 23.7( 31407)  GCG 20.8( 27656)  GAG 19.7( 26176)  GGG  8.8( 11704)

Coding GC 45.30% 1st letter GC 54.57% 2nd letter GC 38.88% 3rd letter GC 42.45%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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