Paracoccus denitrificans PD1222 [gbbct]: 5106 CDS's (1593906 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  6.6( 10514)  UCU  1.3(  2057)  UAU 12.5( 19912)  UGU  0.8(  1308)
UUC 27.9( 44541)  UCC  9.0( 14302)  UAC  7.7( 12254)  UGC  8.0( 12731)
UUA  0.2(   360)  UCA  1.2(  1835)  UAA  0.3(   520)  UGA  2.4(  3833)
UUG  7.2( 11444)  UCG 21.1( 33573)  UAG  0.5(   753)  UGG 14.7( 23504)

CUU 10.4( 16576)  CCU  2.6(  4160)  CAU 12.3( 19582)  CGU  4.6(  7385)
CUC 11.0( 17583)  CCC 21.7( 34525)  CAC  8.6( 13718)  CGC 44.6( 71017)
CUA  0.8(  1317)  CCA  1.9(  2972)  CAA  5.5(  8751)  CGA  2.4(  3787)
CUG 74.6(118934)  CCG 29.8( 47424)  CAG 26.7( 42548)  CGG 22.0( 35000)

AUU  3.3(  5269)  ACU  1.2(  1947)  AAU  5.7(  9006)  AGU  1.3(  2012)
AUC 45.7( 72853)  ACC 30.5( 48672)  AAC 17.1( 27225)  AGC 14.6( 23299)
AUA  1.0(  1541)  ACA  1.8(  2848)  AAA  4.4(  7083)  AGA  0.9(  1403)
AUG 26.7( 42506)  ACG 15.7( 25000)  AAG 20.2( 32219)  AGG  3.5(  5518)

GUU  3.7(  5975)  GCU  4.3(  6849)  GAU 18.1( 28800)  GGU  6.2(  9844)
GUC 33.2( 52970)  GCC 67.1(106912)  GAC 38.1( 60804)  GGC 61.5( 98076)
GUA  1.1(  1726)  GCA  7.9( 12534)  GAA 18.5( 29458)  GGA  4.6(  7258)
GUG 32.1( 51215)  GCG 52.9( 84343)  GAG 38.4( 61156)  GGG 18.1( 28865)

Coding GC 67.18% 1st letter GC 68.51% 2nd letter GC 47.98% 3rd letter GC 85.04%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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