Escherichia coli W3110 [gbbct]: 4332 CDS's (1372057 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 22.2( 30462)  UCU  8.4( 11512)  UAU 16.1( 22037)  UGU  5.1(  7016)
UUC 16.5( 22705)  UCC  8.6( 11802)  UAC 12.2( 16795)  UGC  6.4(  8797)
UUA 13.8( 18894)  UCA  7.0(  9620)  UAA  2.0(  2765)  UGA  0.9(  1249)
UUG 13.6( 18664)  UCG  8.9( 12210)  UAG  0.2(   321)  UGG 15.2( 20889)

CUU 11.0( 15082)  CCU  7.0(  9540)  CAU 13.0( 17791)  CGU 21.0( 28866)
CUC 11.1( 15272)  CCC  5.5(  7490)  CAC  9.8( 13399)  CGC 22.3( 30530)
CUA  3.8(  5266)  CCA  8.4( 11569)  CAA 15.4( 21121)  CGA  3.5(  4810)
CUG 53.1( 72898)  CCG 23.4( 32080)  CAG 29.0( 39835)  CGG  5.4(  7401)

AUU 30.4( 41644)  ACU  8.8( 12119)  AAU 17.6( 24106)  AGU  8.7( 11924)
AUC 25.2( 34568)  ACC 23.5( 32265)  AAC 21.6( 29581)  AGC 16.1( 22067)
AUA  4.2(  5733)  ACA  6.9(  9452)  AAA 33.6( 46116)  AGA  2.0(  2771)
AUG 27.8( 38167)  ACG 14.4( 19820)  AAG 10.3( 14174)  AGG  1.1(  1496)

GUU 18.2( 24991)  GCU 15.2( 20813)  GAU 32.2( 44217)  GGU 24.7( 33875)
GUC 15.3( 21050)  GCC 25.7( 35252)  GAC 19.1( 26270)  GGC 29.8( 40849)
GUA 10.9( 14901)  GCA 20.1( 27567)  GAA 39.7( 54431)  GGA  7.9( 10774)
GUG 26.3( 36108)  GCG 33.9( 46524)  GAG 18.0( 24629)  GGG 11.0( 15115)

Coding GC 51.93% 1st letter GC 59.06% 2nd letter GC 40.67% 3rd letter GC 56.05%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
Homepage