Synechococcus sp. CC9902 [gbbct]: 2304 CDS's (668139 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 16.6( 11118)  UCU  7.8(  5216)  UAU  8.9(  5919)  UGU  5.2(  3483)
UUC 15.7( 10482)  UCC 11.4(  7596)  UAC  9.9(  6613)  UGC  7.4(  4957)
UUA  9.1(  6075)  UCA  8.5(  5679)  UAA  1.0(   693)  UGA  2.0(  1328)
UUG 29.5( 19696)  UCG  9.7(  6453)  UAG  0.4(   283)  UGG 17.3( 11567)

CUU 20.9( 13955)  CCU 11.4(  7598)  CAU 11.6(  7728)  CGU 15.8( 10544)
CUC 26.7( 17853)  CCC 16.0( 10686)  CAC 10.2(  6794)  CGC 22.0( 14729)
CUA  6.4(  4243)  CCA 13.7(  9179)  CAA 24.4( 16328)  CGA 11.5(  7713)
CUG 29.2( 19508)  CCG 12.0(  7991)  CAG 22.8( 15218)  CGG 12.4(  8308)

AUU 19.9( 13320)  ACU  7.1(  4752)  AAU 14.4(  9623)  AGU 10.3(  6878)
AUC 24.3( 16229)  ACC 20.3( 13567)  AAC 15.7( 10504)  AGC 18.2( 12183)
AUA  2.5(  1663)  ACA  9.4(  6282)  AAA 16.4( 10936)  AGA  3.6(  2383)
AUG 20.4( 13643)  ACG 12.3(  8223)  AAG 14.6(  9781)  AGG  3.5(  2364)

GUU 19.8( 13224)  GCU 23.0( 15391)  GAU 33.0( 22076)  GGU 21.0( 14049)
GUC 13.7(  9179)  GCC 35.7( 23823)  GAC 22.1( 14756)  GGC 27.2( 18173)
GUA  4.2(  2807)  GCA 18.4( 12279)  GAA 30.6( 20451)  GGA 18.4( 12283)
GUG 32.3( 21551)  GCG 20.1( 13453)  GAG 26.3( 17564)  GGG 13.8(  9216)

Coding GC 54.87% 1st letter GC 62.66% 2nd letter GC 44.65% 3rd letter GC 57.31%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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