Rhodopseudomonas palustris HaA2 [gbbct]: 4683 CDS's (1551417 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  4.3(  6642)  UCU  1.1(  1715)  UAU 10.0( 15523)  UGU  0.9(  1426)
UUC 32.1( 49811)  UCC 10.6( 16448)  UAC 12.1( 18811)  UGC  7.4( 11468)
UUA  0.3(   473)  UCA  1.3(  2019)  UAA  0.4(   652)  UGA  1.9(  3001)
UUG  7.9( 12283)  UCG 24.5( 37959)  UAG  0.7(  1030)  UGG 12.6( 19504)

CUU  2.8(  4303)  CCU  1.8(  2826)  CAU  7.7( 12000)  CGU  4.8(  7454)
CUC 29.4( 45593)  CCC 11.1( 17147)  CAC 11.5( 17832)  CGC 40.0( 62054)
CUA  0.9(  1451)  CCA  1.8(  2740)  CAA  4.8(  7394)  CGA  3.2(  4942)
CUG 57.8( 89596)  CCG 38.8( 60166)  CAG 27.1( 42011)  CGG 19.1( 29581)

AUU  4.8(  7420)  ACU  1.8(  2762)  AAU  8.5( 13224)  AGU  1.9(  2914)
AUC 47.7( 73981)  ACC 32.2( 50023)  AAC 17.6( 27283)  AGC 15.9( 24607)
AUA  0.5(   844)  ACA  1.8(  2717)  AAA  5.8(  8950)  AGA  0.9(  1368)
AUG 23.4( 36236)  ACG 18.6( 28899)  AAG 28.0( 43398)  AGG  2.1(  3319)

GUU  3.4(  5327)  GCU  5.0(  7810)  GAU 17.5( 27158)  GGU  6.1(  9519)
GUC 36.3( 56341)  GCC 56.0( 86892)  GAC 40.7( 63132)  GGC 64.6(100278)
GUA  1.1(  1658)  GCA  6.2(  9598)  GAA 18.8( 29167)  GGA  4.8(  7453)
GUG 34.0( 52728)  GCG 62.4( 96855)  GAG 31.7( 49117)  GGG  9.4( 14584)

Coding GC 66.47% 1st letter GC 66.05% 2nd letter GC 47.06% 3rd letter GC 86.31%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
Homepage