Rhodopseudomonas palustris BisB5 [gbbct]: 4397 CDS's (1416770 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  5.2(  7317)  UCU  1.6(  2204)  UAU 10.2( 14504)  UGU  1.1(  1595)
UUC 31.2( 44221)  UCC 10.7( 15149)  UAC 11.4( 16205)  UGC  7.4( 10473)
UUA  0.5(   698)  UCA  2.0(  2816)  UAA  0.5(   689)  UGA  2.0(  2773)
UUG  9.5( 13392)  UCG 24.0( 33986)  UAG  0.7(   935)  UGG 12.5( 17773)

CUU  4.7(  6651)  CCU  2.6(  3700)  CAU  8.6( 12218)  CGU  6.0(  8510)
CUC 29.3( 41553)  CCC 10.7( 15130)  CAC 11.0( 15563)  CGC 38.7( 54867)
CUA  1.3(  1883)  CCA  2.5(  3477)  CAA  5.6(  7921)  CGA  3.9(  5596)
CUG 53.9( 76353)  CCG 37.2( 52769)  CAG 26.5( 37535)  CGG 18.9( 26713)

AUU  6.2(  8721)  ACU  2.5(  3513)  AAU  8.9( 12592)  AGU  2.1(  2949)
AUC 46.7( 66180)  ACC 30.4( 43093)  AAC 17.3( 24570)  AGC 15.4( 21751)
AUA  0.8(  1085)  ACA  2.5(  3509)  AAA  6.6(  9296)  AGA  1.1(  1548)
AUG 23.6( 33489)  ACG 17.8( 25166)  AAG 28.7( 40732)  AGG  2.5(  3540)

GUU  5.0(  7103)  GCU  7.0(  9870)  GAU 18.7( 26532)  GGU  7.2( 10150)
GUC 35.6( 50494)  GCC 51.5( 72978)  GAC 38.3( 54332)  GGC 61.2( 86640)
GUA  1.6(  2257)  GCA  8.0( 11379)  GAA 20.0( 28404)  GGA  6.1(  8585)
GUG 31.9( 45258)  GCG 61.6( 87236)  GAG 32.1( 45481)  GGG  9.3( 13168)

Coding GC 65.40% 1st letter GC 65.66% 2nd letter GC 46.77% 3rd letter GC 83.76%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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