Rhodopseudomonas palustris BisB18 [gbbct]: 4886 CDS's (1572513 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  6.6( 10303)  UCU  1.4(  2134)  UAU 10.3( 16166)  UGU  1.1(  1762)
UUC 29.5( 46465)  UCC 11.6( 18287)  UAC 11.0( 17273)  UGC  7.7( 12101)
UUA  0.7(  1114)  UCA  1.8(  2899)  UAA  0.5(   857)  UGA  1.8(  2908)
UUG 14.8( 23238)  UCG 22.8( 35850)  UAG  0.7(  1121)  UGG 12.3( 19319)

CUU  4.7(  7433)  CCU  2.2(  3468)  CAU  8.6( 13456)  CGU  5.0(  7816)
CUC 25.3( 39839)  CCC 10.7( 16782)  CAC 11.2( 17668)  CGC 39.1( 61468)
CUA  1.6(  2513)  CCA  2.3(  3613)  CAA  7.4( 11609)  CGA  3.6(  5664)
CUG 54.6( 85911)  CCG 37.3( 58683)  CAG 26.4( 41463)  CGG 19.9( 31351)

AUU  6.5( 10200)  ACU  2.0(  3194)  AAU  8.2( 12946)  AGU  2.2(  3504)
AUC 45.7( 71813)  ACC 33.4( 52540)  AAC 17.8( 27964)  AGC 16.7( 26329)
AUA  0.7(  1176)  ACA  1.8(  2908)  AAA  7.3( 11453)  AGA  1.0(  1576)
AUG 22.7( 35697)  ACG 14.9( 23408)  AAG 27.0( 42445)  AGG  2.2(  3412)

GUU  4.5(  7019)  GCU  5.9(  9259)  GAU 18.2( 28691)  GGU  6.2(  9771)
GUC 32.2( 50579)  GCC 58.0( 91257)  GAC 38.0( 59791)  GGC 60.2( 94741)
GUA  1.5(  2393)  GCA  6.9( 10774)  GAA 21.3( 33541)  GGA  5.4(  8504)
GUG 36.2( 56910)  GCG 59.6( 93798)  GAG 30.5( 47917)  GGG 10.5( 16469)

Coding GC 65.45% 1st letter GC 65.51% 2nd letter GC 46.78% 3rd letter GC 84.06%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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