Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K [gbbct]: 1921 CDS's (554832 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 25.0( 13896)  UCU  6.6(  3677)  UAU 21.5( 11925)  UGU  3.5(  1955)
UUC 15.9(  8848)  UCC  2.8(  1576)  UAC 12.6(  6978)  UGC  1.4(   752)
UUA 47.0( 26053)  UCA 16.9(  9383)  UAA  2.5(  1361)  UGA  0.3(   158)
UUG 20.7( 11466)  UCG  4.5(  2484)  UAG  0.7(   402)  UGG  9.8(  5421)

CUU 10.3(  5690)  CCU  8.7(  4845)  CAU 12.4(  6861)  CGU 12.6(  6997)
CUC  8.9(  4923)  CCC  4.3(  2377)  CAC  7.7(  4258)  CGC  9.4(  5188)
CUA 10.1(  5627)  CCA 17.6(  9784)  CAA 45.0( 24969)  CGA  5.0(  2767)
CUG  5.1(  2812)  CCG  6.5(  3594)  CAG  9.6(  5330)  CGG  8.4(  4683)

AUU 46.0( 25496)  ACU 14.3(  7931)  AAU 26.1( 14476)  AGU 15.7(  8716)
AUC 22.9( 12711)  ACC 12.6(  7005)  AAC 17.3(  9601)  AGC  7.5(  4178)
AUA  2.9(  1586)  ACA 21.4( 11865)  AAA 38.0( 21064)  AGA  3.3(  1834)
AUG 26.9( 14908)  ACG 17.3(  9606)  AAG 20.6( 11414)  AGG  0.5(   275)

GUU 29.9( 16607)  GCU 25.6( 14187)  GAU 40.8( 22622)  GGU 27.4( 15209)
GUC 18.3( 10169)  GCC 20.3( 11276)  GAC 13.4(  7430)  GGC 19.3( 10729)
GUA  8.2(  4532)  GCA 24.1( 13356)  GAA 48.4( 26880)  GGA  5.8(  3211)
GUG 14.6(  8104)  GCG 17.3(  9579)  GAG  6.9(  3853)  GGG 13.3(  7382)

Coding GC 41.88% 1st letter GC 51.52% 2nd letter GC 36.40% 3rd letter GC 37.73%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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