Vibrio fischeri ES114 [gbbct]: 3833 CDS's (1246370 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 30.3( 37825)  UCU 18.9( 23612)  UAU 19.8( 24617)  UGU  7.5(  9327)
UUC 11.9( 14853)  UCC  2.7(  3383)  UAC 11.5( 14377)  UGC  2.6(  3247)
UUA 43.8( 54572)  UCA 18.6( 23200)  UAA  2.3(  2868)  UGA  0.3(   400)
UUG 12.4( 15481)  UCG  4.7(  5846)  UAG  0.5(   565)  UGG 11.8( 14728)

CUU 20.1( 25070)  CCU 15.0( 18665)  CAU 13.8( 17188)  CGU 20.5( 25575)
CUC  3.8(  4688)  CCC  1.5(  1920)  CAC  7.7(  9659)  CGC  6.1(  7587)
CUA 14.7( 18325)  CCA 16.6( 20701)  CAA 34.1( 42464)  CGA  6.6(  8167)
CUG  6.9(  8597)  CCG  3.8(  4697)  CAG  8.4( 10473)  CGG  0.5(   651)

AUU 41.7( 51998)  ACU 17.2( 21406)  AAU 30.1( 37491)  AGU 14.4( 17977)
AUC 18.6( 23122)  ACC 10.0( 12467)  AAC 17.3( 21511)  AGC  8.7( 10845)
AUA  9.7( 12126)  ACA 18.7( 23345)  AAA 45.6( 56830)  AGA  5.8(  7202)
AUG 26.7( 33321)  ACG  9.7( 12070)  AAG 12.9( 16040)  AGG  0.9(  1155)

GUU 30.7( 38282)  GCU 28.5( 35539)  GAU 43.1( 53758)  GGU 34.9( 43477)
GUC  5.8(  7254)  GCC  8.3( 10328)  GAC 11.5( 14395)  GGC 13.7( 17054)
GUA 19.5( 24297)  GCA 29.2( 36456)  GAA 47.3( 58930)  GGA 10.5( 13148)
GUG 11.1( 13869)  GCG 13.6( 16903)  GAG 18.2( 22649)  GGG  6.3(  7797)

Coding GC 39.02% 1st letter GC 51.23% 2nd letter GC 36.82% 3rd letter GC 29.01%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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