Thermus thermophilus HB8 [gbbct]: 2238 CDS's (669747 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  6.7(  4471)  UCU  0.7(   495)  UAU  1.2(   830)  UGU  0.2(   125)
UUC 30.9( 20692)  UCC 15.3( 10233)  UAC 27.5( 18407)  UGC  3.7(  2493)
UUA  1.1(   744)  UCA  0.3(   210)  UAA  0.6(   431)  UGA  1.4(   970)
UUG  9.6(  6428)  UCG  3.8(  2561)  UAG  1.2(   837)  UGG 13.8(  9274)

CUU 16.9( 11332)  CCU  4.5(  3009)  CAU  0.9(   582)  CGU  1.5(  1006)
CUC 72.9( 48852)  CCC 48.0( 32153)  CAC 17.7( 11824)  CGC 29.0( 19436)
CUA  3.3(  2184)  CCA  1.4(   969)  CAA  3.1(  2076)  CGA  1.1(   766)
CUG 41.0( 27438)  CCG 11.6(  7757)  CAG 21.2( 14228)  CGG 36.8( 24675)

AUU  2.4(  1594)  ACU  0.4(   291)  AAU  0.4(   273)  AGU  0.4(   263)
AUC 22.3( 14902)  ACC 27.0( 18095)  AAC 15.1( 10097)  AGC 13.8(  9217)
AUA  1.2(   789)  ACA  0.4(   298)  AAA  2.9(  1930)  AGA  0.8(   533)
AUG 14.4(  9621)  ACG  9.5(  6356)  AAG 32.6( 21825)  AGG 16.3( 10939)

GUU  2.5(  1706)  GCU  2.6(  1751)  GAU  1.7(  1112)  GGU  2.2(  1456)
GUC 27.0( 18068)  GCC 84.7( 56708)  GAC 34.1( 22864)  GGC 37.0( 24778)
GUA  1.5(   992)  GCA  1.7(  1134)  GAA 10.6(  7089)  GGA  5.5(  3662)
GUG 50.1( 33558)  GCG 26.2( 17562)  GAG 75.3( 50430)  GGG 48.3( 32366)

Coding GC 69.67% 1st letter GC 72.19% 2nd letter GC 45.02% 3rd letter GC 91.78%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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