PRRSV HB-1(sh)/2002 [gbvrl]: 6 CDS's (3470 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number]) 
UUU 29.1(   101)  UCU 20.2(    70)  UAU 10.7(    37)  UGU 14.1(    49)
UUC 20.5(    71)  UCC 20.5(    71)  UAC 11.8(    41)  UGC 17.0(    59)
UUA  7.2(    25)  UCA  9.8(    34)  UAA  0.0(     0)  UGA  0.9(     3)
UUG 25.1(    87)  UCG  8.6(    30)  UAG  0.9(     3)  UGG 20.7(    72)

CUU 24.5(    85)  CCU 22.5(    78)  CAU 14.1(    49)  CGU  7.8(    27)
CUC 22.2(    77)  CCC 18.2(    63)  CAC 10.7(    37)  CGC  9.8(    34)
CUA  7.2(    25)  CCA 12.4(    43)  CAA 15.0(    52)  CGA  6.3(    22)
CUG 20.2(    70)  CCG 14.4(    50)  CAG 15.9(    55)  CGG  8.9(    31)

AUU 16.7(    58)  ACU 14.1(    49)  AAU 14.7(    51)  AGU 10.4(    36)
AUC 15.9(    55)  ACC 23.1(    80)  AAC 16.7(    58)  AGC 11.2(    39)
AUA  6.3(    22)  ACA 11.0(    38)  AAA 18.2(    63)  AGA  8.6(    30)
AUG 21.6(    75)  ACG  9.2(    32)  AAG 19.6(    68)  AGG 12.1(    42)

GUU 24.5(    85)  GCU 25.1(    87)  GAU 17.3(    60)  GGU 20.2(    70)
GUC 25.4(    88)  GCC 28.2(    98)  GAC 20.7(    72)  GGC 22.5(    78)
GUA  8.6(    30)  GCA 15.6(    54)  GAA 17.6(    61)  GGA 10.7(    37)
GUG 27.7(    96)  GCG 13.8(    48)  GAG 26.8(    93)  GGG 19.0(    66)
Coding GC 52.64% 1st letter GC 55.36% 2nd letter GC 46.69% 3rd letter GC 55.88%
Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM
CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS (format)
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