Shigella dysenteriae Sd197 [gbbct]: 4505 CDS's (1173369 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 20.4( 23943)  UCU  8.9( 10387)  UAU 15.8( 18505)  UGU  5.2(  6062)
UUC 17.2( 20167)  UCC  8.5(  9986)  UAC 13.0( 15306)  UGC  7.3(  8534)
UUA 12.6( 14759)  UCA  7.3(  8621)  UAA  2.5(  2959)  UGA  1.0(  1172)
UUG 12.9( 15124)  UCG  9.0( 10504)  UAG  0.3(   375)  UGG 15.6( 18363)

CUU 11.4( 13381)  CCU  6.6(  7765)  CAU 12.9( 15079)  CGU 22.0( 25846)
CUC 11.2( 13162)  CCC  5.5(  6502)  CAC 11.0( 12953)  CGC 22.9( 26853)
CUA  4.2(  4873)  CCA  8.1(  9538)  CAA 14.9( 17540)  CGA  3.7(  4380)
CUG 53.7( 63038)  CCG 22.0( 25813)  CAG 28.8( 33823)  CGG  7.3(  8565)

AUU 28.1( 32933)  ACU  9.4( 11043)  AAU 16.8( 19655)  AGU  8.7( 10238)
AUC 25.2( 29598)  ACC 23.2( 27217)  AAC 21.6( 25344)  AGC 16.2( 19012)
AUA  4.8(  5636)  ACA  7.7(  9002)  AAA 34.4( 40321)  AGA  2.8(  3318)
AUG 27.5( 32264)  ACG 15.4( 18012)  AAG 11.4( 13377)  AGG  2.0(  2310)

GUU 18.1( 21254)  GCU 15.7( 18468)  GAU 30.4( 35696)  GGU 23.3( 27373)
GUC 14.6( 17161)  GCC 24.5( 28716)  GAC 19.3( 22632)  GGC 28.6( 33560)
GUA 11.0( 12881)  GCA 19.8( 23210)  GAA 39.3( 46062)  GGA  8.6( 10081)
GUG 25.9( 30446)  GCG 31.8( 37345)  GAG 18.8( 22021)  GGG 11.3( 13305)

Coding GC 52.04% 1st letter GC 58.75% 2nd letter GC 41.00% 3rd letter GC 56.37%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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