Thiobacillus denitrificans ATCC 25259 [gbbct]: 2827 CDS's (897568 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  5.5(  4893)  UCU  1.0(   938)  UAU  6.6(  5934)  UGU  1.3(  1131)
UUC 30.0( 26966)  UCC  7.7(  6925)  UAC 17.6( 15806)  UGC  7.6(  6858)
UUA  0.6(   517)  UCA  1.4(  1240)  UAA  0.6(   508)  UGA  2.1(  1849)
UUG  7.8(  7030)  UCG 18.9( 16925)  UAG  0.5(   470)  UGG 13.5( 12084)

CUU  5.8(  5177)  CCU  2.9(  2566)  CAU  6.7(  6008)  CGU  7.7(  6890)
CUC 45.6( 40930)  CCC 16.4( 14717)  CAC 16.5( 14814)  CGC 47.6( 42703)
CUA  1.6(  1412)  CCA  2.0(  1808)  CAA  5.1(  4535)  CGA  2.6(  2353)
CUG 48.2( 43226)  CCG 29.9( 26846)  CAG 29.0( 26052)  CGG 12.9( 11584)

AUU  4.8(  4335)  ACU  1.7(  1490)  AAU  5.2(  4704)  AGU  2.2(  2008)
AUC 37.4( 33536)  ACC 24.0( 21567)  AAC 20.1( 18005)  AGC 18.3( 16394)
AUA  1.3(  1128)  ACA  1.9(  1699)  AAA  7.2(  6444)  AGA  1.0(   858)
AUG 22.4( 20087)  ACG 21.6( 19424)  AAG 25.9( 23216)  AGG  2.3(  2066)

GUU  4.2(  3788)  GCU  5.0(  4482)  GAU 10.9(  9827)  GGU  7.3(  6559)
GUC 42.7( 38312)  GCC 53.3( 47812)  GAC 44.8( 40169)  GGC 57.0( 51137)
GUA  2.5(  2280)  GCA  9.0(  8044)  GAA 24.8( 22252)  GGA  5.2(  4669)
GUG 27.0( 24266)  GCG 62.4( 56041)  GAG 32.4( 29078)  GGG 11.4( 10196)

Coding GC 66.39% 1st letter GC 68.02% 2nd letter GC 45.89% 3rd letter GC 85.26%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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