Jannaschia sp. CCS1 [gbbct]: 4283 CDS's (1331836 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number]) 
UUU 12.3( 16425)  UCU  4.2(  5651)  UAU 10.6( 14102)  UGU  2.4(  3233)
UUC 25.1( 33369)  UCC 15.1( 20086)  UAC 11.0( 14709)  UGC  6.7(  8885)
UUA  1.1(  1516)  UCA  3.5(  4647)  UAA  0.7(   880)  UGA  1.8(  2422)
UUG 16.4( 21799)  UCG 13.2( 17626)  UAG  0.7(   981)  UGG 14.1( 18842)

CUU 13.4( 17845)  CCU  4.7(  6275)  CAU 10.0( 13337)  CGU  8.0( 10700)
CUC 14.3( 19065)  CCC 21.0( 27982)  CAC 11.1( 14736)  CGC 32.2( 42920)
CUA  2.1(  2749)  CCA  4.8(  6352)  CAA  9.7( 12930)  CGA  3.4(  4522)
CUG 51.2( 68256)  CCG 21.9( 29138)  CAG 21.9( 29129)  CGG 18.0( 24003)

AUU 10.7( 14272)  ACU  2.8(  3749)  AAU  8.3( 11031)  AGU  2.9(  3908)
AUC 39.7( 52935)  ACC 26.7( 35556)  AAC 17.0( 22634)  AGC 11.5( 15255)
AUA  1.8(  2348)  ACA  6.5(  8597)  AAA  9.2( 12250)  AGA  1.2(  1594)
AUG 28.1( 37441)  ACG 22.6( 30078)  AAG 16.3( 21686)  AGG  2.3(  3013)

GUU  9.3( 12384)  GCU  8.2( 10983)  GAU 28.8( 38354)  GGU 12.7( 16975)
GUC 26.8( 35736)  GCC 52.2( 69456)  GAC 35.5( 47247)  GGC 47.0( 62626)
GUA  2.3(  3065)  GCA 13.8( 18425)  GAA 21.0( 27986)  GGA  7.4(  9840)
GUG 34.7( 46255)  GCG 51.1( 67997)  GAG 34.3( 45706)  GGG 20.5( 27342)
Coding GC 62.61% 1st letter GC 65.35% 2nd letter GC 46.45% 3rd letter GC 76.02%
Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM
CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
Homepage