Clostridium perfringens SM101 [gbbct]: 2578 CDS's (791457 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 37.4( 29618)  UCU 16.3( 12888)  UAU 33.8( 26736)  UGU  9.2(  7301)
UUC  8.8(  6957)  UCC  2.2(  1747)  UAC  6.6(  5199)  UGC  2.3(  1792)
UUA 61.5( 48676)  UCA 20.2( 16027)  UAA  2.4(  1905)  UGA  0.2(   123)
UUG  4.0(  3127)  UCG  0.5(   360)  UAG  0.7(   553)  UGG  6.7(  5288)

CUU 19.4( 15393)  CCU 11.9(  9381)  CAU 10.4(  8252)  CGU  1.3(  1053)
CUC  0.4(   346)  CCC  0.6(   440)  CAC  2.7(  2121)  CGC  0.1(   109)
CUA  8.1(  6421)  CCA 14.1( 11151)  CAA 17.1( 13513)  CGA  0.2(   179)
CUG  0.5(   420)  CCG  0.5(   371)  CAG  2.6(  2082)  CGG  0.0(    24)

AUU 32.2( 25513)  ACU 22.9( 18144)  AAU 53.2( 42144)  AGU 17.5( 13877)
AUC  4.2(  3334)  ACC  2.8(  2205)  AAC 11.0(  8741)  AGC  5.2(  4128)
AUA 60.2( 47616)  ACA 18.7( 14815)  AAA 67.0( 53025)  AGA 29.0( 22961)
AUG 24.3( 19239)  ACG  0.8(   637)  AAG 27.6( 21843)  AGG  3.2(  2554)

GUU 33.5( 26522)  GCU 28.8( 22765)  GAU 47.4( 37530)  GGU 18.8( 14851)
GUC  1.5(  1161)  GCC  4.1(  3215)  GAC  6.8(  5412)  GGC  3.4(  2672)
GUA 25.7( 20366)  GCA 19.5( 15397)  GAA 62.0( 49086)  GGA 37.5( 29714)
GUG  3.7(  2917)  GCG  1.3(  1004)  GAG 18.0( 14281)  GGG  5.4(  4235)

Coding GC 29.16% 1st letter GC 40.73% 2nd letter GC 30.50% 3rd letter GC 16.24%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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