PRRSV LV4.2.1 [gbvrl]: 8 CDS's (3673 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 24.2(    89)  UCU 22.6(    83)  UAU  8.4(    31)  UGU 16.3(    60)
UUC 25.9(    95)  UCC 24.8(    91)  UAC 14.7(    54)  UGC 13.3(    49)
UUA  7.4(    27)  UCA 14.4(    53)  UAA  0.8(     3)  UGA  0.8(     3)
UUG 22.3(    82)  UCG  9.3(    34)  UAG  0.5(     2)  UGG 21.0(    77)

CUU 25.6(    94)  CCU 18.8(    69)  CAU 15.2(    56)  CGU  9.5(    35)
CUC 24.5(    90)  CCC 14.4(    53)  CAC 13.3(    49)  CGC 12.5(    46)
CUA  7.6(    28)  CCA 15.2(    56)  CAA 17.4(    64)  CGA  8.2(    30)
CUG 19.9(    73)  CCG 12.0(    44)  CAG 18.5(    68)  CGG  8.7(    32)

AUU 14.4(    53)  ACU 13.1(    48)  AAU 10.6(    39)  AGU  8.7(    32)
AUC 15.8(    58)  ACC 22.6(    83)  AAC 17.4(    64)  AGC  8.7(    32)
AUA  8.2(    30)  ACA 12.5(    46)  AAA 18.2(    67)  AGA  6.3(    23)
AUG 18.2(    67)  ACG 10.3(    38)  AAG 18.8(    69)  AGG  8.7(    32)

GUU 25.3(    93)  GCU 30.8(   113)  GAU 19.6(    72)  GGU 23.7(    87)
GUC 22.1(    81)  GCC 30.2(   111)  GAC 21.5(    79)  GGC 23.4(    86)
GUA  8.4(    31)  GCA 15.2(    56)  GAA 16.6(    61)  GGA  8.7(    32)
GUG 25.6(    94)  GCG  9.5(    35)  GAG 22.3(    82)  GGG 16.1(    59)

Coding GC 52.60% 1st letter GC 56.06% 2nd letter GC 47.05% 3rd letter GC 54.70%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS (format)
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