Pseudomonas [gbbct]: 5134 CDS's (1743874 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  3.6(  6224)  UCU  1.1(  1922)  UAU  5.8( 10050)  UGU  1.4(  2359)
UUC 31.6( 55051)  UCC  8.8( 15408)  UAC 19.5( 34008)  UGC  8.8( 15402)
UUA  0.6(   990)  UCA  1.5(  2582)  UAA  0.5(   876)  UGA  2.1(  3641)
UUG 14.3( 24952)  UCG 14.2( 24676)  UAG  0.4(   617)  UGG 14.6( 25476)

CUU  4.1(  7089)  CCU  4.1(  7117)  CAU  7.1( 12355)  CGU 10.7( 18697)
CUC 19.0( 33136)  CCC 13.6( 23741)  CAC 16.8( 29254)  CGC 41.5( 72296)
CUA  1.5(  2593)  CCA  5.1(  8947)  CAA  8.9( 15476)  CGA  2.2(  3751)
CUG 80.7(140737)  CCG 26.3( 45948)  CAG 38.7( 67511)  CGG 10.5( 18240)

AUU  4.9(  8531)  ACU  2.7(  4636)  AAU  4.7(  8209)  AGU  3.7(  6493)
AUC 37.6( 65587)  ACC 34.4( 59924)  AAC 24.1( 42035)  AGC 25.0( 43577)
AUA  0.9(  1559)  ACA  2.0(  3425)  AAA  6.0( 10460)  AGA  0.6(   995)
AUG 21.6( 37712)  ACG  8.2( 14246)  AAG 25.9( 45121)  AGG  1.8(  3074)

GUU  3.8(  6580)  GCU  6.2( 10861)  GAU 13.4( 23298)  GGU 12.9( 22543)
GUC 24.5( 42797)  GCC 66.2(115487)  GAC 41.0( 71414)  GGC 54.7( 95339)
GUA  4.1(  7087)  GCA  7.8( 13566)  GAA 22.7( 39605)  GGA  1.9(  3263)
GUG 39.8( 69326)  GCG 31.9( 55595)  GAG 33.9( 59057)  GGG 12.2( 21350)

Coding GC 64.93% 1st letter GC 66.75% 2nd letter GC 43.84% 3rd letter GC 84.19%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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