Yarrowia lipolytica CLIB122 [gbpln]: 5967 CDS's (2945919 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 15.9( 46804)  UCU 21.8( 64161)  UAU  6.8( 20043)  UGU  6.1( 17849)
UUC 23.0( 67672)  UCC 20.6( 60695)  UAC 23.1( 68146)  UGC  6.1( 17903)
UUA  1.8(  5280)  UCA  7.8( 22845)  UAA  0.8(  2494)  UGA  0.4(  1148)
UUG 10.4( 30576)  UCG 15.4( 45255)  UAG  0.8(  2325)  UGG 12.1( 35555)

CUU 13.2( 38890)  CCU 17.4( 51329)  CAU  9.6( 28191)  CGU  6.0( 17622)
CUC 22.6( 66461)  CCC 23.3( 68633)  CAC 14.4( 42490)  CGC  4.4( 12915)
CUA  5.3( 15548)  CCA  6.9( 20234)  CAA  9.8( 28769)  CGA 21.7( 63881)
CUG 33.5( 98823)  CCG  6.8( 20042)  CAG 32.1( 94609)  CGG  7.7( 22606)

AUU 22.4( 66134)  ACU 16.2( 47842)  AAU  8.9( 26184)  AGU  6.7( 19861)
AUC 24.4( 71810)  ACC 25.6( 75551)  AAC 31.3( 92161)  AGC  9.8( 28855)
AUA  2.2(  6342)  ACA 10.5( 30844)  AAA 12.4( 36672)  AGA  8.4( 24674)
AUG 22.6( 66620)  ACG  8.5( 25021)  AAG 46.5(136914)  AGG  2.4(  7208)

GUU 15.8( 46530)  GCU 25.5( 75193)  GAU 21.5( 63259)  GGU 16.6( 48902)
GUC 21.5( 63401)  GCC 32.7( 96219)  GAC 38.3(112759)  GGC 21.8( 64272)
GUA  4.0( 11840)  GCA 11.2( 32999)  GAA 18.8( 55382)  GGA 20.9( 61597)
GUG 25.7( 75765)  GCG  8.9( 26190)  GAG 46.2(136241)  GGG  4.4( 12883)

Coding GC 53.65% 1st letter GC 56.84% 2nd letter GC 41.44% 3rd letter GC 62.68%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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