Pyrococcus abyssi GE5 [gbbct]: 1786 CDS's (542185 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number]) 
UUU 16.4(  8882)  UCU  6.9(  3731)  UAU 14.1(  7620)  UGU  2.5(  1336)
UUC 27.0( 14649)  UCC  7.1(  3857)  UAC 24.2( 13115)  UGC  3.0(  1641)
UUA 16.7(  9064)  UCA  8.9(  4843)  UAA  1.0(   516)  UGA  1.7(   917)
UUG 14.7(  7948)  UCG  5.2(  2825)  UAG  0.7(   353)  UGG 11.8(  6386)

CUU 21.3( 11575)  CCU  9.2(  4980)  CAU  5.7(  3086)  CGU  1.0(   565)
CUC 20.7( 11197)  CCC  9.9(  5350)  CAC  9.3(  5044)  CGC  1.2(   630)
CUA 18.5( 10020)  CCA 16.8(  9132)  CAA  7.3(  3970)  CGA  0.9(   478)
CUG 10.6(  5741)  CCG  6.4(  3495)  CAG  9.3(  5054)  CGG  0.6(   343)

AUU 21.1( 11459)  ACU 11.1(  6000)  AAU 13.0(  7044)  AGU  7.5(  4049)
AUC 15.3(  8316)  ACC 10.9(  5894)  AAC 20.3( 11020)  AGC 13.9(  7545)
AUA 48.2( 26112)  ACA  8.1(  4386)  AAA 24.5( 13272)  AGA 16.8(  9127)
AUG 23.1( 12510)  ACG 11.8(  6405)  AAG 53.3( 28897)  AGG 36.6( 19818)

GUU 39.1( 21180)  GCU 20.2( 10942)  GAU 27.5( 14923)  GGU 15.4(  8375)
GUC 15.0(  8111)  GCC 19.2( 10408)  GAC 18.5( 10025)  GGC 10.9(  5887)
GUA 13.6(  7368)  GCA 16.7(  9077)  GAA 35.5( 19271)  GGA 30.0( 16288)
GUG 13.5(  7325)  GCG 10.3(  5583)  GAG 52.6( 28533)  GGG 16.0(  8692)
Coding GC 45.14% 1st letter GC 50.29% 2nd letter GC 34.86% 3rd letter GC 50.28%
Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM
CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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