Lactobacillus acidophilus NCFM [gbbct]: 1862 CDS's (586361 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 32.0( 18740)  UCU 12.7(  7449)  UAU 28.1( 16454)  UGU  4.0(  2339)
UUC 11.0(  6438)  UCC  2.5(  1493)  UAC 10.7(  6302)  UGC  1.4(   826)
UUA 41.5( 24351)  UCA 18.9( 11054)  UAA  2.3(  1327)  UGA  0.3(   150)
UUG 19.1( 11171)  UCG  2.4(  1399)  UAG  0.7(   385)  UGG 10.3(  6052)

CUU 17.6( 10327)  CCU 11.9(  6977)  CAU 14.2(  8321)  CGU 14.9(  8709)
CUC  2.2(  1271)  CCC  1.7(   996)  CAC  6.0(  3510)  CGC  3.8(  2236)
CUA  7.0(  4121)  CCA 18.8( 11029)  CAA 31.9( 18710)  CGA  3.9(  2292)
CUG  3.2(  1857)  CCG  3.1(  1813)  CAG  6.0(  3523)  CGG  1.2(   712)

AUU 54.5( 31979)  ACU 31.8( 18659)  AAU 43.6( 25579)  AGU 16.5(  9704)
AUC 14.6(  8558)  ACC  6.6(  3861)  AAC 14.6(  8587)  AGC  5.7(  3338)
AUA  8.7(  5130)  ACA 14.7(  8600)  AAA 47.9( 28060)  AGA 11.7(  6871)
AUG 26.1( 15319)  ACG  4.6(  2720)  AAG 31.9( 18715)  AGG  1.4(   806)

GUU 33.6( 19699)  GCU 32.3( 18912)  GAU 49.4( 28966)  GGU 34.3( 20097)
GUC  5.5(  3236)  GCC  7.8(  4577)  GAC 11.7(  6847)  GGC 11.0(  6463)
GUA 22.0( 12876)  GCA 25.7( 15085)  GAA 49.3( 28886)  GGA 14.1(  8274)
GUG  6.5(  3824)  GCG  4.5(  2617)  GAG  7.7(  4487)  GGG  4.6(  2695)

Coding GC 35.21% 1st letter GC 46.72% 2nd letter GC 33.90% 3rd letter GC 25.01%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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