Clostridium difficile 630 [gbbct]: 3711 CDS's (1173018 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number]) 
UUU 37.4( 43878)  UCU 18.8( 22084)  UAU 33.4( 39131)  UGU 10.5( 12273)
UUC  5.9(  6864)  UCC  2.0(  2301)  UAC  7.3(  8555)  UGC  1.9(  2244)
UUA 45.8( 53723)  UCA 18.6( 21776)  UAA  2.2(  2548)  UGA  0.2(   250)
UUG 11.8( 13825)  UCG  1.4(  1608)  UAG  0.8(   913)  UGG  6.2(  7285)

CUU 18.9( 22124)  CCU 10.2( 11971)  CAU 11.2( 13100)  CGU  2.6(  3017)
CUC  1.3(  1502)  CCC  0.8(   892)  CAC  2.3(  2732)  CGC  0.5(   618)
CUA 10.4( 12182)  CCA 15.4( 18111)  CAA 19.0( 22315)  CGA  1.2(  1391)
CUG  2.7(  3185)  CCG  0.9(  1101)  CAG  4.8(  5662)  CGG  0.2(   292)

AUU 33.3( 39055)  ACU 21.1( 24760)  AAU 52.3( 61392)  AGU 20.0( 23457)
AUC  5.7(  6725)  ACC  2.5(  2883)  AAC 10.5( 12333)  AGC  4.5(  5258)
AUA 59.6( 69923)  ACA 23.4( 27467)  AAA 68.2( 80000)  AGA 24.0( 28175)
AUG 26.5( 31081)  ACG  2.2(  2549)  AAG 22.5( 26397)  AGG  3.6(  4174)

GUU 26.0( 30557)  GCU 22.5( 26374)  GAU 46.7( 54725)  GGU 23.6( 27644)
GUC  2.9(  3425)  GCC  2.9(  3351)  GAC 10.2( 11967)  GGC  3.7(  4310)
GUA 31.0( 36421)  GCA 26.3( 30876)  GAA 58.4( 68446)  GGA 30.4( 35708)
GUG  6.3(  7388)  GCG  1.9(  2222)  GAG 15.3( 17978)  GGG  5.6(  6544)
Coding GC 30.10% 1st letter GC 41.61% 2nd letter GC 30.94% 3rd letter GC 17.75%
Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM
CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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