Bacteroides fragilis NCTC 9343 [gbbct]: 4225 CDS's (1537469 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 24.6( 37792)  UCU 12.5( 19206)  UAU 31.1( 47850)  UGU  7.0( 10829)
UUC 21.6( 33211)  UCC  9.0( 13881)  UAC 13.6( 20945)  UGC  5.2(  8071)
UUA 13.3( 20407)  UCA  8.8( 13573)  UAA  1.7(  2607)  UGA  0.6(   997)
UUG 23.3( 35769)  UCG  9.9( 15146)  UAG  0.4(   621)  UGG 12.6( 19369)

CUU 14.6( 22437)  CCU 11.2( 17166)  CAU 11.9( 18256)  CGU 16.7( 25605)
CUC  9.2( 14211)  CCC  8.5( 13138)  CAC  6.4(  9840)  CGC  9.3( 14302)
CUA  4.8(  7376)  CCA  4.0(  6205)  CAA 16.0( 24577)  CGA  3.6(  5555)
CUG 27.6( 42395)  CCG 14.1( 21649)  CAG 18.4( 28271)  CGG  7.7( 11810)

AUU 26.6( 40878)  ACU 14.9( 22886)  AAU 30.0( 46074)  AGU 11.8( 18099)
AUC 26.1( 40198)  ACC 16.3( 25023)  AAC 20.3( 31225)  AGC  9.5( 14621)
AUA 17.1( 26297)  ACA 14.9( 22873)  AAA 42.3( 65070)  AGA  6.5(  9992)
AUG 26.9( 41313)  ACG  9.9( 15150)  AAG 23.7( 36461)  AGG  3.3(  5115)

GUU 14.0( 21518)  GCU 20.0( 30822)  GAU 33.1( 50949)  GGU 21.2( 32544)
GUC 10.5( 16088)  GCC 22.1( 33919)  GAC 20.8( 31973)  GGC 12.6( 19351)
GUA 21.8( 33566)  GCA 18.5( 28377)  GAA 43.9( 67520)  GGA 26.4( 40599)
GUG 18.4( 28343)  GCG  8.1( 12492)  GAG 21.0( 32357)  GGG  8.3( 12709)

Coding GC 44.14% 1st letter GC 50.47% 2nd letter GC 36.49% 3rd letter GC 45.46%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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