Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406 [gbbct]: 3785 CDS's (1331624 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 34.4( 45819)  UCU 15.6( 20790)  UAU 30.5( 40582)  UGU  6.2(  8241)
UUC 14.5( 19335)  UCC  9.0( 12010)  UAC 13.7( 18210)  UGC  4.2(  5622)
UUA 28.9( 38435)  UCA 14.9( 19894)  UAA  2.0(  2677)  UGA  0.4(   575)
UUG 15.9( 21175)  UCG  7.0(  9265)  UAG  0.4(   533)  UGG 10.8( 14397)

CUU 16.9( 22491)  CCU 10.4( 13844)  CAU 12.1( 16048)  CGU 10.4( 13823)
CUC  3.9(  5128)  CCC  4.7(  6224)  CAC  6.5(  8719)  CGC  6.6(  8740)
CUA  4.0(  5329)  CCA  7.5( 10039)  CAA 13.8( 18410)  CGA  1.8(  2369)
CUG 21.5( 28570)  CCG 13.7( 18221)  CAG 20.7( 27551)  CGG  4.0(  5361)

AUU 39.8( 53014)  ACU  9.7( 12974)  AAU 35.8( 47693)  AGU 10.8( 14368)
AUC 21.6( 28724)  ACC 14.9( 19817)  AAC 19.6( 26064)  AGC 11.1( 14844)
AUA 17.1( 22718)  ACA 30.0( 39917)  AAA 55.2( 73499)  AGA  8.6( 11446)
AUG 21.9( 29111)  ACG 12.6( 16723)  AAG 14.5( 19344)  AGG  2.1(  2835)

GUU 24.1( 32062)  GCU 18.1( 24153)  GAU 38.2( 50906)  GGU 23.9( 31776)
GUC  3.3(  4432)  GCC 13.0( 17252)  GAC 12.3( 16431)  GGC 17.6( 23460)
GUA 26.5( 35332)  GCA 30.4( 40513)  GAA 46.4( 61842)  GGA 17.0( 22572)
GUG 10.7( 14238)  GCG 10.8( 14431)  GAG  9.9( 13131)  GGG  5.7(  7575)

Coding GC 39.61% 1st letter GC 46.63% 2nd letter GC 36.35% 3rd letter GC 35.86%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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