Methanosarcina barkeri str. Fusaro [gbbct]: 3625 CDS's (1131217 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 26.7( 30151)  UCU 14.7( 16615)  UAU 22.3( 25230)  UGU  6.4(  7236)
UUC 16.1( 18231)  UCC 11.4( 12951)  UAC 14.1( 15947)  UGC  6.0(  6767)
UUA 11.6( 13162)  UCA 15.1( 17047)  UAA  1.8(  2067)  UGA  1.2(  1396)
UUG  8.6(  9756)  UCG  6.1(  6846)  UAG  0.1(   164)  UGG 10.4( 11724)

CUU 33.4( 37766)  CCU 16.7( 18842)  CAU 10.0( 11278)  CGU  4.6(  5176)
CUC 14.0( 15884)  CCC  6.6(  7503)  CAC  6.5(  7346)  CGC  4.2(  4751)
CUA  6.5(  7328)  CCA  9.4( 10666)  CAA  8.2(  9271)  CGA  3.5(  3915)
CUG 19.7( 22271)  CCG  6.5(  7375)  CAG 17.6( 19882)  CGG  3.9(  4397)

AUU 32.9( 37221)  ACU 17.2( 19494)  AAU 28.5( 32196)  AGU 11.9( 13498)
AUC 20.8( 23538)  ACC 13.0( 14660)  AAC 19.6( 22185)  AGC 10.5( 11909)
AUA 23.6( 26668)  ACA 18.0( 20411)  AAA 47.3( 53515)  AGA 14.2( 16043)
AUG 23.2( 26231)  ACG  6.4(  7271)  AAG 22.7( 25674)  AGG 11.8( 13320)

GUU 23.2( 26286)  GCU 20.9( 23619)  GAU 31.7( 35826)  GGU 14.5( 16451)
GUC 12.5( 14095)  GCC 14.3( 16231)  GAC 20.3( 22925)  GGC 13.7( 15500)
GUA 20.7( 23437)  GCA 26.9( 30385)  GAA 53.7( 60710)  GGA 29.1( 32889)
GUG 11.7( 13197)  GCG  5.9(  6724)  GAG 22.4( 25374)  GGG 13.1( 14793)

Coding GC 42.25% 1st letter GC 50.57% 2nd letter GC 36.81% 3rd letter GC 39.38%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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