Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 [gbbct]: 3140 CDS's (988497 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  3.8(  3758)  UCU  1.7(  1663)  UAU  1.3(  1245)  UGU  0.5(   492)
UUC 29.4( 29050)  UCC 19.3( 19063)  UAC 24.1( 23863)  UGC  7.6(  7495)
UUA  0.4(   393)  UCA  0.7(   670)  UAA  0.2(   246)  UGA  1.6(  1554)
UUG  3.6(  3535)  UCG 12.0( 11813)  UAG  1.4(  1340)  UGG 12.4( 12252)

CUU  4.0(  3964)  CCU  2.0(  1970)  CAU  1.0(  1034)  CGU  2.2(  2198)
CUC 51.3( 50699)  CCC 25.6( 25312)  CAC 16.6( 16436)  CGC 35.7( 35338)
CUA  1.1(  1109)  CCA  1.1(  1118)  CAA  0.9(   932)  CGA  1.5(  1447)
CUG 49.8( 49271)  CCG 27.1( 26774)  CAG 19.9( 19703)  CGG 38.9( 38459)

AUU  0.8(   744)  ACU  0.7(   716)  AAU  0.7(   677)  AGU  0.6(   558)
AUC 27.3( 26963)  ACC 26.8( 26489)  AAC 17.8( 17636)  AGC 15.4( 15177)
AUA  8.9(  8773)  ACA  0.9(   864)  AAA  1.6(  1581)  AGA  2.1(  2100)
AUG 17.8( 17557)  ACG 12.0( 11868)  AAG 18.7( 18496)  AGG 16.0( 15774)

GUU  3.2(  3160)  GCU  3.7(  3701)  GAU  3.7(  3649)  GGU  3.8(  3713)
GUC 33.7( 33315)  GCC 66.3( 65506)  GAC 39.7( 39258)  GGC 47.1( 46537)
GUA  2.9(  2855)  GCA  2.9(  2877)  GAA  4.1(  4043)  GGA  5.3(  5210)
GUG 45.2( 44719)  GCG 46.0( 45518)  GAG 79.2( 78291)  GGG 46.5( 45976)

Coding GC 70.94% 1st letter GC 71.23% 2nd letter GC 48.58% 3rd letter GC 93.02%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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