Ralstonia eutropha JMP134 [gbbct]: 6547 CDS's (2153075 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  6.3( 13656)  UCU  1.8(  3945)  UAU  7.6( 16411)  UGU  1.2(  2603)
UUC 28.3( 60927)  UCC  9.5( 20555)  UAC 16.0( 34490)  UGC  8.6( 18575)
UUA  0.5(   989)  UCA  2.3(  4929)  UAA  0.6(  1256)  UGA  2.0(  4326)
UUG  8.5( 18288)  UCG 20.2( 43428)  UAG  0.4(   965)  UGG 13.7( 29545)

CUU  7.3( 15702)  CCU  4.0(  8713)  CAU  8.7( 18781)  CGU  8.4( 18033)
CUC 21.3( 45967)  CCC 13.0( 27962)  CAC 13.9( 30034)  CGC 44.1( 94860)
CUA  1.8(  3899)  CCA  4.1(  8831)  CAA  6.6( 14289)  CGA  3.1(  6635)
CUG 62.7(135104)  CCG 31.5( 67905)  CAG 31.1( 67029)  CGG 12.2( 26286)

AUU  7.6( 16331)  ACU  3.1(  6686)  AAU  7.0( 15107)  AGU  2.6(  5543)
AUC 36.4( 78380)  ACC 23.5( 50687)  AAC 19.5( 41940)  AGC 17.5( 37729)
AUA  1.0(  2118)  ACA  3.4(  7245)  AAA  3.8(  8249)  AGA  0.8(  1775)
AUG 25.7( 55412)  ACG 23.0( 49420)  AAG 26.0( 56018)  AGG  2.4(  5162)

GUU  5.1( 11029)  GCU  8.9( 19152)  GAU 16.6( 35765)  GGU  9.6( 20672)
GUC 27.0( 58173)  GCC 53.7(115538)  GAC 36.1( 77738)  GGC 59.8(128825)
GUA  4.7( 10050)  GCA 14.8( 31973)  GAA 24.9( 53614)  GGA  5.5( 11794)
GUG 40.3( 86833)  GCG 51.3(110481)  GAG 26.9( 57865)  GGG  9.7( 20853)

Coding GC 65.09% 1st letter GC 66.90% 2nd letter GC 46.94% 3rd letter GC 81.42%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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