Rhodopseudomonas palustris CGA009 [gbbct]: 4822 CDS's (1587998 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  5.0(  7976)  UCU  1.7(  2639)  UAU  9.5( 15082)  UGU  1.2(  1904)
UUC 31.3( 49635)  UCC 10.0( 15857)  UAC 12.7( 20093)  UGC  7.3( 11567)
UUA  0.5(   774)  UCA  2.0(  3248)  UAA  0.7(  1075)  UGA  1.8(  2911)
UUG  7.9( 12518)  UCG 24.1( 38309)  UAG  0.5(   836)  UGG 12.8( 20247)

CUU  4.7(  7422)  CCU  2.8(  4492)  CAU  7.6( 12077)  CGU  6.7( 10591)
CUC 28.5( 45234)  CCC  9.8( 15568)  CAC 12.1( 19224)  CGC 38.2( 60621)
CUA  1.8(  2885)  CCA  2.8(  4505)  CAA  4.9(  7755)  CGA  3.4(  5358)
CUG 57.0( 90585)  CCG 38.3( 60803)  CAG 27.8( 44203)  CGG 19.2( 30459)

AUU  5.7(  8991)  ACU  2.9(  4555)  AAU  7.6( 12032)  AGU  2.1(  3295)
AUC 46.3( 73473)  ACC 32.8( 52092)  AAC 18.2( 28824)  AGC 15.8( 25149)
AUA  0.5(   870)  ACA  2.3(  3709)  AAA  5.5(  8681)  AGA  0.8(  1243)
AUG 22.9( 36366)  ACG 16.5( 26173)  AAG 29.6( 46983)  AGG  1.7(  2640)

GUU  4.9(  7786)  GCU  8.2( 13006)  GAU 19.0( 30099)  GGU  9.2( 14652)
GUC 33.4( 53054)  GCC 54.0( 85801)  GAC 37.4( 59348)  GGC 60.4( 95982)
GUA  1.8(  2905)  GCA  9.0( 14322)  GAA 20.5( 32501)  GGA  5.0(  7998)
GUG 34.9( 55487)  GCG 56.4( 89585)  GAG 31.6( 50167)  GGG  8.7( 13776)

Coding GC 65.53% 1st letter GC 66.01% 2nd letter GC 46.79% 3rd letter GC 83.79%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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