Lactobacillus johnsonii NCC 533 [gbbct]: 1828 CDS's (594867 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 34.3( 20431)  UCU 15.8(  9418)  UAU 27.4( 16270)  UGU  4.0(  2388)
UUC  9.6(  5696)  UCC  3.2(  1895)  UAC 10.3(  6110)  UGC  1.4(   842)
UUA 46.1( 27405)  UCA 16.4(  9737)  UAA  2.1(  1265)  UGA  0.2(   143)
UUG 14.4(  8568)  UCG  2.4(  1441)  UAG  0.7(   420)  UGG 10.6(  6321)

CUU 17.2( 10216)  CCU 11.9(  7095)  CAU 13.8(  8223)  CGU 12.0(  7161)
CUC  3.2(  1894)  CCC  2.1(  1244)  CAC  5.4(  3231)  CGC  3.6(  2166)
CUA 11.0(  6567)  CCA 18.1( 10761)  CAA 31.2( 18589)  CGA  4.5(  2683)
CUG  3.2(  1907)  CCG  3.0(  1776)  CAG  7.1(  4222)  CGG  1.7(   983)

AUU 55.9( 33245)  ACU 31.0( 18436)  AAU 43.8( 26050)  AGU 17.7( 10521)
AUC 12.3(  7344)  ACC  6.5(  3853)  AAC 14.2(  8432)  AGC  6.7(  3960)
AUA  8.6(  5145)  ACA 14.9(  8861)  AAA 49.6( 29518)  AGA 12.0(  7110)
AUG 24.9( 14793)  ACG  4.5(  2662)  AAG 30.1( 17891)  AGG  1.7(  1013)

GUU 34.0( 20243)  GCU 32.6( 19403)  GAU 46.8( 27848)  GGU 26.8( 15948)
GUC  5.8(  3440)  GCC  8.1(  4827)  GAC 12.0(  7150)  GGC  9.5(  5676)
GUA 21.4( 12727)  GCA 24.8( 14758)  GAA 49.3( 29298)  GGA 21.2( 12603)
GUG  5.9(  3490)  GCG  4.2(  2528)  GAG 10.0(  5977)  GGG  5.1(  3049)

Coding GC 34.95% 1st letter GC 46.68% 2nd letter GC 33.83% 3rd letter GC 24.34%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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