PRRSV HN1 [gbvrl]: 7 CDS's (3695 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number]) 
UUU 28.7(   106)  UCU 16.0(    59)  UAU  8.7(    32)  UGU 16.0(    59)
UUC 18.7(    69)  UCC 20.3(    75)  UAC 14.1(    52)  UGC 15.4(    57)
UUA  5.7(    21)  UCA 10.6(    39)  UAA  0.3(     1)  UGA  0.8(     3)
UUG 26.5(    98)  UCG  8.4(    31)  UAG  0.8(     3)  UGG 20.0(    74)

CUU 22.7(    84)  CCU 22.7(    84)  CAU 13.5(    50)  CGU  7.6(    28)
CUC 21.4(    79)  CCC 17.3(    64)  CAC 10.3(    38)  CGC 11.6(    43)
CUA  7.8(    29)  CCA 15.2(    56)  CAA 13.5(    50)  CGA  5.1(    19)
CUG 20.0(    74)  CCG 13.5(    50)  CAG 18.1(    67)  CGG 10.6(    39)

AUU 15.4(    57)  ACU 16.8(    62)  AAU 14.6(    54)  AGU 10.3(    38)
AUC 16.0(    59)  ACC 22.5(    83)  AAC 16.2(    60)  AGC 10.3(    38)
AUA  7.0(    26)  ACA  9.2(    34)  AAA 19.5(    72)  AGA 11.1(    41)
AUG 20.0(    74)  ACG  8.4(    31)  AAG 22.5(    83)  AGG  9.5(    35)

GUU 26.3(    97)  GCU 26.8(    99)  GAU 17.3(    64)  GGU 16.0(    59)
GUC 24.4(    90)  GCC 29.2(   108)  GAC 22.2(    82)  GGC 25.7(    95)
GUA  6.8(    25)  GCA 17.6(    65)  GAA 18.4(    68)  GGA 11.4(    42)
GUG 29.2(   108)  GCG 14.1(    52)  GAG 24.9(    92)  GGG 18.7(    69)
Coding GC 52.97% 1st letter GC 55.99% 2nd letter GC 46.85% 3rd letter GC 56.08%
Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM
CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS (format)
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