Silicibacter pomeroyi DSS-3 [gbbct]: 4252 CDS's (1378453 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 12.3( 16900)  UCU  2.1(  2828)  UAU 14.6( 20153)  UGU  2.2(  3060)
UUC 24.2( 33413)  UCC  8.2( 11312)  UAC  7.8( 10691)  UGC  7.3( 10008)
UUA  0.3(   447)  UCA  1.8(  2471)  UAA  0.5(   679)  UGA  2.2(  2971)
UUG  9.1( 12492)  UCG 20.1( 27644)  UAG  0.4(   602)  UGG 14.2( 19607)

CUU  8.4( 11539)  CCU  2.8(  3838)  CAU 12.2( 16764)  CGU  6.4(  8866)
CUC 12.6( 17317)  CCC 20.8( 28645)  CAC  9.1( 12600)  CGC 37.8( 52123)
CUA  1.1(  1461)  CCA  2.6(  3617)  CAA  6.2(  8529)  CGA  2.3(  3114)
CUG 71.7( 98887)  CCG 25.8( 35520)  CAG 26.5( 36529)  CGG 20.0( 27579)

AUU  5.4(  7388)  ACU  1.9(  2551)  AAU  7.0(  9711)  AGU  2.3(  3159)
AUC 43.1( 59461)  ACC 35.1( 48413)  AAC 18.0( 24785)  AGC 15.5( 21395)
AUA  1.2(  1651)  ACA  3.5(  4865)  AAA  7.7( 10630)  AGA  1.0(  1427)
AUG 27.5( 37900)  ACG 12.1( 16668)  AAG 20.7( 28475)  AGG  2.3(  3131)

GUU  6.8(  9322)  GCU  5.1(  7091)  GAU 23.5( 32416)  GGU 11.4( 15742)
GUC 26.6( 36629)  GCC 60.8( 83815)  GAC 35.3( 48654)  GGC 52.4( 72281)
GUA  2.2(  3087)  GCA  9.6( 13275)  GAA 21.9( 30244)  GGA  5.3(  7338)
GUG 36.7( 50549)  GCG 49.2( 67862)  GAG 35.4( 48764)  GGG 20.0( 27568)

Coding GC 64.63% 1st letter GC 66.86% 2nd letter GC 46.41% 3rd letter GC 80.62%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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