Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901 [gbbct]: 2620 CDS's (724267 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number]) 
UUU 39.5( 28632)  UCU  6.7(  4852)  UAU 22.3( 16119)  UGU  4.7(  3404)
UUC  6.1(  4438)  UCC  9.8(  7109)  UAC 14.0( 10159)  UGC  4.2(  3071)
UUA 42.2( 30589)  UCA  4.3(  3132)  UAA  2.4(  1719)  UGA  0.6(   403)
UUG 16.7( 12114)  UCG  6.3(  4598)  UAG  0.7(   510)  UGG  8.5(  6137)

CUU 25.1( 18149)  CCU  9.5(  6852)  CAU  8.9(  6466)  CGU  4.8(  3451)
CUC  5.7(  4151)  CCC 12.0(  8724)  CAC  6.1(  4420)  CGC  6.3(  4531)
CUA  5.6(  4036)  CCA  5.6(  4067)  CAA 12.7(  9186)  CGA  3.5(  2500)
CUG 14.8( 10697)  CCG 14.7( 10611)  CAG 15.4( 11175)  CGG 16.1( 11695)

AUU 42.8( 30964)  ACU 12.2(  8853)  AAU 25.4( 18412)  AGU  9.3(  6736)
AUC 13.8( 10005)  ACC 22.2( 16073)  AAC 15.5( 11229)  AGC  9.1(  6618)
AUA 18.0( 13051)  ACA  6.2(  4484)  AAA 55.9( 40460)  AGA  8.6(  6235)
AUG 20.0( 14469)  ACG  7.3(  5272)  AAG 22.3( 16153)  AGG  7.7(  5576)

GUU 27.1( 19606)  GCU 23.3( 16841)  GAU 29.8( 21616)  GGU 20.8( 15070)
GUC  6.9(  5019)  GCC 23.4( 16971)  GAC 12.6(  9104)  GGC 14.7( 10663)
GUA 22.7( 16442)  GCA 14.5( 10483)  GAA 57.2( 41425)  GGA 22.0( 15910)
GUG 18.5( 13398)  GCG 15.0( 10892)  GAG 22.0( 15919)  GGG 17.4( 12621)
Coding GC 42.40% 1st letter GC 51.46% 2nd letter GC 35.13% 3rd letter GC 40.61%
Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM
CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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